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YEYE 夏天

新虫 (初入文坛)

[求助] 质粒DNA的测序结果怎么看? 已有1人参与

研一入门,求指教
以M13为引物扩增转化的E.coli 提取出的质粒DNA拿去公司测序了,回来的测序结果怎么看?用什么软件呀?求大神推荐

此外,做的是马铃薯的第二内含子的增强子表达方面的,主要用到CRISPR/Cas9基因编辑技术,文献读的还不是太懂,有了解的师兄师姐吗

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酷莱博

新虫 (小有名气)

这个质粒是你克隆过的,还是纯质粒,只是做鉴定。的pcr产物应该没多大,克隆过的你应该知道产物是什么序列。只是坚定的话,最简单的把序列文件txt打开,百度blast ,ncbi网站里面有这个选项,把序列复制粘进去,blast,直接就告诉你最像哪个质粒的序列。复杂一点。就用sequence,把你的载体序列和测序结果都粘进去,比对一下

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6楼2017-10-28 20:13:24
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zaofa1108

新虫 (小有名气)

2楼2017-10-28 00:31:37
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zaofa1108

新虫 (小有名气)

具体怎么比对楼主还是找身边师兄师姐给你实际演示一次,这样子不好讲

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3楼2017-10-28 00:32:58
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小阳sunny

新虫 (初入文坛)

快乐做研究!
4楼2017-10-28 08:00:00
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酷莱博

新虫 (小有名气)

5楼2017-10-28 20:08:57
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深夜吃糖

新虫 (初入文坛)

7楼2017-10-30 15:48:59
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一一ab

新虫 (小有名气)

8楼2017-10-31 00:07:50
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vagbio

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

内容已删除
9楼2017-11-02 16:39:01
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前行的璐

新虫 (小有名气)

我一般用NCBI比对的,还有你CRISPR/Cas9技术是用来敲除基因吗?还是
10楼2017-11-03 21:35:32
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