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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 序列比对
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lvtd

金虫 (小有名气)

[交流] 序列比对

我做了个基因的蛋白序列比对，和其他物种的比对结果都是58-59%
能说明什么啊？
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tobeornottobe,thisisaquestion!
1楼 2009-02-20 16:05:04
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chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫
58-59已经很高了
楼主推荐你去 ncbi 用BlastX 输入核苷酸序列比较蛋白的命令 注意是fasta 格式的DNA序列 看结果给出的是什么颜色 应该是绿色以上吧 看看功能就可以了
你的58-59是Identity吧 那已经比较高了可以看功能了 只要不是黑色的就行

还有一种理解是你有几条不同的序列之间对比 那就是说已知功能了? 那就直接分析保守区域就可以了 不用在乎信息学数值
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Bemühen Sie !
4楼2009-02-21 22:05:00
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bioinflab

银虫 (小有名气)
怎么叫都是58-59%？
没有更高的或更低的？
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2楼2009-02-20 19:27:51
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yumo

新虫 (小有名气)
把拿来对比的蛋白之间再对比一下。
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3楼2009-02-20 22:01:42
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