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mechefy

新虫 (小有名气)

[求助] 去除100bp左右的小片段的方法? 已有2人参与

我的实验要构建基因组文库,需要把基因组提取出来后,切下2-4kb的片段,但是我切下来相应的条带回收纯化之后,发现每次2-4kb里都混了好多100bp左右小片段,这些小片段很大的影响了我的实验,我只需要回收纯化出2-4kb的片段,请问大家有谁知道有没有什么胶回收试剂盒,可以过滤掉这种小片段,保留下我的2-4kb的基因组,或者还有什么其他办法,去除100bp左右的基因组?
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mechefy

新虫 (小有名气)

有人吗
2楼2017-10-23 18:47:45
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13027726151

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mechefy: 金币+5, 有帮助 2017-10-23 23:36:36
你是用磁珠纯化的吗,可以降低一下磁珠比例,就可以去除100bp左右的片段
3楼2017-10-23 19:27:07
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mechefy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 13027726151 at 2017-10-23 19:27:07
你是用磁珠纯化的吗,可以降低一下磁珠比例,就可以去除100bp左右的片段

不是啊,是用的胶回收柱式纯化回收试剂盒
4楼2017-10-23 19:33:18
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jinweistu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你是怎么确定含有这些100bp小条带的呢?胶回收柱法是不大可能回收到的
5楼2017-10-26 10:23:58
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mechefy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jinweistu at 2017-10-26 10:23:58
你是怎么确定含有这些100bp小条带的呢?胶回收柱法是不大可能回收到的

因为我挑了几个载体测序,测出来都连上了100bp左右的小片段
6楼2017-10-27 15:21:58
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602059625

金虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

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mechefy: 金币+56, ★★★★★最佳答案 2017-11-08 20:20:06
用磁珠size selection最方便,跑电泳割胶回收也可以
AMPure XP bead
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=填写姓名&say=这里填写您想说的内容。[/img][/url]
7楼2017-10-29 14:24:43
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602059625

金虫 (知名作家)

基因组切完之后应该跑电泳看下片段大小分布
[url=http://ip.WoTuLa.com][img]http://i.WoTuLa.com/note.png?name=填写姓名&say=这里填写您想说的内容。[/img][/url]
8楼2017-10-29 14:25:54
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