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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】势能对相对距离的函数的计算
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trickle111

[交流] 【求助】势能对相对距离的函数的计算

有高人知道什么模块可以计算两个不同分子之间势能对相对距离的函数的计算软件么

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-25 at 13:08 ]
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1楼 2009-02-19 21:23:00
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tttl060

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks！ 2-20 23:39
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 3-13 10:13
两个分子之间的相互作用势能,就是非键能(electrostastic and van der waals interactions),这个能量跟两者的距离有关,是其函数.也是分子间聚合能.

注意区分两分子体系的总势能,这里可是有键能存在的....

分子构象变了,其作用能必然变,要不怎么说是其距离的函数呢!

楼主的问题说的很含糊,呵呵.....具体指什么?  读者很难一目了然..
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3楼2009-02-20 21:15:26
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zczc6

银虫 (小有名气)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks！ 2-19 22:01
问题本身有问题。

即使两分子的质心距离恒定，任意分子构象稍有变化机就会引起相互作用势能变化啊。
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2楼2009-02-19 21:27:57
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trickle111

感谢楼上的，
我是看了篇文献，它计算了水分子对一个表面的能量对距离的函数，得到了相互作用距离，我也想尝试着这么做
至于分子变化，我觉得可以用固定分子构型来解决
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4楼2009-03-12 15:53:45
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