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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】：Ubuntu下安装Gaussian03 问题
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hbzjdd

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】：Ubuntu下安装Gaussian03 问题

最近弄了台4核的机器，装windows后不能把充分利用四核资源；想请教下Ubuntu下如何安装Gaussian03？

[ Last edited by mingdong on 2009-2-19 at 16:59 ]
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1楼 2009-02-19 15:49:52
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
hbzjdd(金币+2,VIP+0):谢谢snoopyzhao！ 2-19 21:12
与别的发行版应该没有任何区别，我想……
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2楼2009-02-19 20:36:16
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thank you very much! 2-23 18:56
安装的办法啊,实际上和任何的发行版本都是一样的. 具体的安装方法在Gaussian的主站上面有说明的.

提供一点个人的使用经验:
我在多核心的机器上使用Ubuntu 多核处理器版本, 发现比较卡.
另, Ubuntu多核心版本,尤其是64位的版本,安装G03会遇到库文件的问题,我至今没有搞明白如何处理; 相反在32位的多核心处理器上, 同样的库文件问题很轻松就可以处理,但是64位上,根本不行!

推荐使用RHEL 4.6  4.7  安装上之后,不存在任何问题!
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
3楼2009-02-23 07:32:04
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 2-23 18:57
不会是因为 Ubuntu 的 64 位版本没有提供 32 位兼容库，而你的 g03 需要 32 位兼容库吧？
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4楼2009-02-23 11:49:26
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★ ★ ★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢！ 2-23 16:02
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 2-23 18:57
LS两位差点就吧问题说出来了，Ubuntu的内核不行，最好选择红帽，我现在就是用的和红帽内核一样的一个版本。最好做计算的时候不要用图形界面，远程操作最好。
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
5楼2009-02-23 15:56:49
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
你确定是内核的问题？这种概率一般不大吧……
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6楼2009-02-23 19:44:33
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2009-2-23 19:44:
你确定是内核的问题？这种概率一般不大吧……

当然我不感肯定就是内核的问题，因为我对linux的内核不是很了解。不过我用linux的内核没有出现楼主说的那种问题，所以我只是估计，所以我也就是建议楼主换个内核试试，或许能有所帮助 换个系统不是很麻烦 呵呵 ~~
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
7楼2009-02-23 21:12:53
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

我没说明白

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流2 9-16 00:35
我们购买的是E01 64位的,

刚刚开始,我尝试用Ubuntu 8.04 64位Server 版,结果提示库文件问题,
我挨个解决,安装了一大堆的库文件,其实只有几个需要网路下载,其他的都在光盘中有的.
很快就完全搞定了库文件问题.
可是我配置好文件之后,运行g03指令,就是一个劲的提示我找不到g03指令.
(别提示我没有权限之类的问题,我在服务器上安装G03不是头一次了,用Linux系统也有一点经验了) 无论如何按照官方的知道,就是不能运行g03.

另一个表征,很明显. 我的单机的CPU是双核心的,安装Ubuntu 8.04 64位版的,(机器是64位处理器), 进入系统,发现机器空闲不干活的是后,top看到其中一个CPU core一直维持在12%左右的使用率. 机器相应比较卡. 表现是编辑vi有时候会卡住.

32位的ubuntu 虽然也会遇到库文件问题,同样可以使用光盘来安装解决.
运行C01的高斯,(这个我们这里购买的是32位的) 可以顺利运行. 32位的ubuntu 没有发现很卡的迹象,运行也好. 只是有时候会自动重启,然后偶尔发现某个我写的文件不见了. 自动重启之后, 很多时候,我配置的vsftp也会失效,需要重新启动服务. ( 我在rc.local中写了脚本,让他自动运行的,可是还是会失效).

后来,更换到RHEL 4.7 (5.2 不行,运行有库文件问题, 而且会有点让人匪夷所思)
修正后系统参数后,空闲时,消耗内存25MB,(后台运行VSFTPD SSHD),我不用图形界面启动,除非是为了编辑文档使用启动贼慢的openoffice!
运行很正常.
运行G03各大版本没有问题. (64位的么有问题.再没有安装过32位的)
运行最新版的Gview,第一次会提示库文件问题,但是再次登陆shell后,就会好用!

如果不喜欢折腾,RHEL 4.7 一次性搞定.
喜欢DIY 你完全可以从内核编译做起,自己做一个用于G03的Linux,也是很有意思的事情!

或者,安装一个Ubuntu Server版,自己修正不理想的地方!

不过,不得不承认,Ubuntu在硬件驱动方面,确实很厉害的!

安装RHEL,很多时候会碰到显卡驱动问题, 如果你使用图形界面的话, 而且官方也没提供显卡驱动的话!

祝福发大家好运!
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
8楼2009-02-25 12:50:23
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Q_Diels

木虫 (著名写手)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流2 9-16 00:35
引用回帖:
Originally posted by jiewei at 2009-2-23 15:56:
LS两位差点就吧问题说出来了，Ubuntu的内核不行，最好选择红帽，我现在就是用的和红帽内核一样的一个版本。最好做计算的时候不要用图形界面，远程操作最好。

Linux 所有版本的内核基本上是一样的，只是分为稳定版和测试版而已。稳定版版本较低，测试版版本较新。unbuntu更新较快，使用的一般是测试版的内核。
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9楼2009-06-14 17:03:48
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digilab

木虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励交流2 9-16 00:35
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2009-2-23 07:32:
安装的办法啊,实际上和任何的发行版本都是一样的. 具体的安装方法在Gaussian的主站上面有说明的.

提供一点个人的使用经验:
我在多核心的机器上使用Ubuntu 多核处理器版本, 发现比较卡.
另, Ubuntu多核心版本 ...

g03不会有库文件问题，gview会有
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10楼2009-07-29 18:06:32
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