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汕头大学海洋科学接受调剂
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liang918

金虫 (小有名气)

[交流] 请问miRNA和siRNA有什么区别?

谢谢热心人解答

[ Last edited by amisking on 2009-11-1 at 13:01 ]
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爱老婆,爱工作
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


amisking(金币+1,VIP+0):在鼓励一下! 7-29 22:11
还有,目前认为miR的关键区域是seed区(第2~7个碱基),seed区互补配对的话一般就能起作用,其余碱基不一定完全互补
而siRNA起作用的话,要求所有碱基都互补配对,差一个效果就差别很大

miR通常target到3‘-UTR区域,也有少量可以target到ORF
而siRNA似乎没有什么限制……

基本上siRNA的靶向是一一对应的,而miR可以调控很多基因,一个基因也可以由很多miR调控
3楼2009-02-18 22:51:53
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):高手啊! 7-29 22:10
哇,可以写篇综述了
基本上,你可以认为,miRNA是内源性的siRNA
但是miRNA是单链介导RISC,而siRNA是双链
另,他们的biogenesis有交集但也有不同的地方,比如是同家族的不同成员蛋白来完成的
==b我觉得找篇综述去看看会比较好呢~肯定有的
2楼2009-02-18 22:49:01
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sunqx

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币+5,VIP+0):牛啊! 7-29 22:11
MiRNA不爽地说,“因为siRNA先被人注意到,所以它在我之前成名。”接着,miRNA意兴昂然地讲起了它的身世……



“话说在“广袤”的细胞质中游荡着一个名叫Dicer的浪子。与此同时,在细胞的腹地‘细胞核’中,一个身形颀长的RNA降生了即pri-miRNA。Dicer在细胞质中遇到了一个双链的RNA并被她所吸引,于是尾随她并最终在她身上咬了一口,结果siRNA降生了。Dicer又继续游荡,这时他看到了一个非常漂亮的发夹状的RNA(她其实就是在细胞核中降生的那条RNA的化身pre-miRNA),于是非常仰慕并最终历经艰辛将她咬了一口。这样我就“哇”的一声来到了这个世界上”miRNA说。“我和siRNA有许多共同点,但我们的差别也很多,所以可别把我们混在一起哦,”它补充说。



siRNA是RNAi途径的主要作用物,miRNA和siRNA很容易混淆,他们有许多共同点也有许多不同点。为了能够清楚地让读者弄清两者之间的差异之处,笔者特别将它们之间的差别划分入三个大的阶段:起源阶段、成熟阶段和功能阶段(即调节基因表达的作用阶段)。



在描述两者的差异之前,有必要先说一说它们的共同点:

1.  MiRNA和siRNA都是由22个左右的核苷组成;

2.  它们都是Dicer酶的产物;

3.  它们在起干扰、调节作用时都会和RISC复合体结合;

4.  它们都可以在转录后和翻译水平干扰以抑制靶标基因的翻译;



两者之间的主要差异:

起源阶段

SiRNA:通常是外源的,如病毒感染和人工插入的dsRNA被剪切后产生外源基因进入细胞(注:病毒入侵,或者是自身合成RNA中出现错误,细胞内就会产生双链RNA,来阻止这些异常基因的表达)。

MiRNA:是内源性的,是一种非编码的RNA;由miRNA基因表达出最初的pri-miRNA分子。

成熟过程

SiRNA:直接来源是长链的dsRNA(通常为外源);经过Dicer酶*切割形成双链siRNA,而且每个前体daRNA能够被切割成不定数量的siRNA片段。

MiRNA:在细胞核中转录的较大的pri-miRNA经由Drosha(一种RNAse Ⅲ酶)和Pasha(含有双链RNA结合区域)加工成为单链pre-miRNA;接着,发夹状、部分互补的pre-miRNA在细胞质中被Dicer*(一种RNAse Ⅲ酶)酶切割形成miRNA;在生物体中的表达具有时序性、保守性和组织特异性。



功能阶段

siRNA:它与RISC*(RNA诱导的沉默复合物,使用的AGO蛋白家族的成分为AGO2)结合,以RNAi途径行使功能,即通过与序列互补的靶标mRNA完全结合(与编码区结合),从而降解mRNA以达到抑制蛋白质翻译的目的;它通常用于沉默外源病毒、转座子活性。

MiRNA:它和RISC形成复合体(利用的AGO蛋白家族成员为AGO1)后与靶标mRNA通常发生不完全结合,并且结合的位点是mRNA的非编码区的3’端;它不会降解靶标mRNA,而只是阻止mRNA的翻译; miRNA能够调节与生长发育有关的基因。



注:RISC, RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex; RISC)的组装是在RNAi和miRNA通路中最为复杂的过程。新的研究表明,与siRNA和miRNA结合的RISC复合物并不完全相同其中的AGO蛋白质有AGO1和AGO2之分。刚产生的siRNAs和miRNAs都是双链结构,这种双链结构需要解螺旋才能被组装到RISC中发挥作用。组装后的复合物分别称为siRISC和miRISC。从dsRNA引发RNAi的发生大致划分为三个阶段,即启动、剪切和扩增。

Dicer酶:新的研究表明siRNA成熟需要Dicer-2和R2D2蛋白,而miRNA则依赖Dicer1和它的伴侣loqs蛋白。



在研究人员的不懈努力之下,近期miRNA的基础研究以及应用研究方面取得了许多的重大进展……
4楼2009-02-19 20:54:48
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liang918

金虫 (小有名气)

谢谢,大家都好牛
爱老婆,爱工作
5楼2009-02-20 19:56:03
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