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Autodock对接酶和产物，binding energy极低，可信么 已有1人参与
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新手上路，刚搞懂autodock操作，但是许多参数还不太了解。如题，对接产物1后binding energy低达 -290000，结合点和文献报道的不太一样，这样可信么？对应的底物是 -7.31*e^13 产物2对接，binding energy 是6.9, 对应的底物是 -6.1 而且，使用Genetic Algorithm 遗传算法，参数Maximun Number of evals 改为500000，Autodock操作一次可能没结果，但是多打开dlg文件几次，就会多结果，正常么？-290000这个 模型即使第4-5次打开dlg文件，才出现的。 Cluster后，应该选择binding energy最低的模型还是 丰度更高的模型？  |
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2楼2017-10-11 19:09:35
autodockytu 
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