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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

[求助] 【新人求助】IRC计算不能回到反应物…… 已有1人参与

致各位路过大神

小弟高斯小白一枚,凭借木虫前辈的指导及一周多独自抗争,成功完成了一个对反应路径的计算,但IRC计算时不能回到反应物,烦请各位援手解答。具体情况如下:

我想计算两个羟基自由基进攻对苯二酚的酚羟基氢,产物得到两分子水和一分子对苯醌,方法QST3,时时通过Gview查看变化情况确实如设想一般,虚频也存在,收敛情况也是四个yes,但IRC的结果不能回到反应物,一直就是脱掉的水在打转......

现想请教:

1.IRC计算不适合这种A+B→C+D的反应?

2.计算过程中循环次数不够,读取CHK继续计算会不会对IRC计算有影响?

预先感谢各位的解惑。
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冲!冲!!冲!!!
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量子力学112

新虫 (正式写手)

厉害你是怎么学的高斯?给点宝贵经验

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2楼2017-10-08 00:08:07
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lkk1213

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物,有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态,你再试试!

发自小木虫Android客户端
3楼2017-10-08 00:53:06
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 量子力学112 at 2017-10-08 00:08:07
厉害你是怎么学的高斯?给点宝贵经验

呃,脸红到不会说话了,其实就是自己先看了一下都有什么关键词,挨个试的。

看报错情况,再一点点调整的。
冲!冲!!冲!!!
4楼2017-10-08 08:40:26
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-08 00:53:06
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物,有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态,你再试试!

您看一下我上传的附件,变化过程是正常的脱氢再逐渐变化为对苯醌的,但IRC过程就只是下面的水分子原地打转,是因为我把产物中的水移得太远了么?
【新人求助】IRC计算不能回到反应物……
IRC.PNG


【新人求助】IRC计算不能回到反应物……-1
初始.PNG

冲!冲!!冲!!!
5楼2017-10-08 08:51:54
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量子力学112

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-08 00:53:06
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物,有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态,你再试试!

那你是直接看的高斯说明书吗?

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6楼2017-10-08 09:32:09
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lkk1213

新虫 (正式写手)

看书可以,慢。也可以请教懂得人,快。以后多去计算化学公社看看,有培训,发帖问问题一般都可以解决

发自小木虫Android客户端
7楼2017-10-09 00:40:17
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lkk1213

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by Van_vega at 2017-10-08 08:51:54
您看一下我上传的附件,变化过程是正常的脱氢再逐渐变化为对苯醌的,但IRC过程就只是下面的水分子原地打转,是因为我把产物中的水移得太远了么?

IRC.PNG

初始.PNG
...

做IRC需要起始为TS(过度态),你先检查一下TS的虚频是否正确?只有虚频正确了才有可能得到正确的IRC。还有一个,在你的反应路径中,上下两个氢是同时脱掉?还是分步脱除?

发自小木虫Android客户端
8楼2017-10-09 00:45:29
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-09 00:45:29
做IRC需要起始为TS(过度态),你先检查一下TS的虚频是否正确?只有虚频正确了才有可能得到正确的IRC。还有一个,在你的反应路径中,上下两个氢是同时脱掉?还是分步脱除?
...

一前一后脱掉,但也没差几个构型,就两三个吧,虚频也是可以的,就一直很奇怪为什么会回不去。我试试把对称性降低一点。
冲!冲!!冲!!!
9楼2017-10-09 10:16:26
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 量子力学112 at 2017-10-08 09:32:09
那你是直接看的高斯说明书吗?
...

说明书肯定要看的,最好还是找个人带带吧,哪怕只有一次,自己一点点摸有很多东西都不知道怎么处理,最尴尬的就是你根本不知道一个“正常结束”的计算能不能用。

我在网上找了几个例子,然后把论坛里大家出现的问题都整理了一下,然后就用台式机试的。

我自己现在的情况连半瓶水都算不上,实在不敢给什么建议,大家一起聊一聊,共同进步吧。
冲!冲!!冲!!!
10楼2017-10-09 10:23:13
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