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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【新人求助】IRC计算不能回到反应物……
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)

[求助] 【新人求助】IRC计算不能回到反应物…… 已有1人参与

致各位路过大神

小弟高斯小白一枚，凭借木虫前辈的指导及一周多独自抗争，成功完成了一个对反应路径的计算，但IRC计算时不能回到反应物，烦请各位援手解答。具体情况如下：

我想计算两个羟基自由基进攻对苯二酚的酚羟基氢，产物得到两分子水和一分子对苯醌，方法QST3，时时通过Gview查看变化情况确实如设想一般，虚频也存在，收敛情况也是四个yes，但IRC的结果不能回到反应物，一直就是脱掉的水在打转......

现想请教：

1.IRC计算不适合这种A+B→C+D的反应？

2.计算过程中循环次数不够，读取CHK继续计算会不会对IRC计算有影响？

预先感谢各位的解惑。
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冲！冲！！冲！！！
1楼 2017-10-07 23:48:27
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量子力学112

新虫 (正式写手)
厉害你是怎么学的高斯？给点宝贵经验

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2楼2017-10-08 00:08:07
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lkk1213

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物，有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态，你再试试！

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3楼2017-10-08 00:53:06
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 量子力学112 at 2017-10-08 00:08:07
厉害你是怎么学的高斯？给点宝贵经验

呃，脸红到不会说话了，其实就是自己先看了一下都有什么关键词，挨个试的。

看报错情况，再一点点调整的。
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冲！冲！！冲！！！
4楼2017-10-08 08:40:26
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-08 00:53:06
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物，有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态，你再试试！

您看一下我上传的附件，变化过程是正常的脱氢再逐渐变化为对苯醌的，但IRC过程就只是下面的水分子原地打转，是因为我把产物中的水移得太远了么？
【新人求助】IRC计算不能回到反应物……
IRC.PNG


【新人求助】IRC计算不能回到反应物……-1
初始.PNG
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5楼2017-10-08 08:51:54
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量子力学112

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-08 00:53:06
IRC用于验证中间态是否正确。做IRC只能得到给定中间物对应的两个相对稳定的中间物，有可能不是初始反应物。有可能还存在过度态，你再试试！

那你是直接看的高斯说明书吗？

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6楼2017-10-08 09:32:09
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lkk1213

新虫 (正式写手)
看书可以，慢。也可以请教懂得人，快。以后多去计算化学公社看看，有培训，发帖问问题一般都可以解决

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7楼2017-10-09 00:40:17
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lkk1213

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by Van_vega at 2017-10-08 08:51:54
您看一下我上传的附件，变化过程是正常的脱氢再逐渐变化为对苯醌的，但IRC过程就只是下面的水分子原地打转，是因为我把产物中的水移得太远了么？

IRC.PNG

初始.PNG
...

做IRC需要起始为TS(过度态)，你先检查一下TS的虚频是否正确？只有虚频正确了才有可能得到正确的IRC。还有一个，在你的反应路径中，上下两个氢是同时脱掉？还是分步脱除？

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8楼2017-10-09 00:45:29
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by lkk1213 at 2017-10-09 00:45:29
做IRC需要起始为TS(过度态)，你先检查一下TS的虚频是否正确？只有虚频正确了才有可能得到正确的IRC。还有一个，在你的反应路径中，上下两个氢是同时脱掉？还是分步脱除？
...

一前一后脱掉，但也没差几个构型，就两三个吧，虚频也是可以的，就一直很奇怪为什么会回不去。我试试把对称性降低一点。
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冲！冲！！冲！！！
9楼2017-10-09 10:16:26
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Van_vega

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 量子力学112 at 2017-10-08 09:32:09
那你是直接看的高斯说明书吗？
...

说明书肯定要看的，最好还是找个人带带吧，哪怕只有一次，自己一点点摸有很多东西都不知道怎么处理，最尴尬的就是你根本不知道一个“正常结束”的计算能不能用。

我在网上找了几个例子，然后把论坛里大家出现的问题都整理了一下，然后就用台式机试的。

我自己现在的情况连半瓶水都算不上，实在不敢给什么建议，大家一起聊一聊，共同进步吧。
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冲！冲！！冲！！！
10楼2017-10-09 10:23:13
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