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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 心得、技巧、经验分享 » 虚拟筛选中靶点的问题
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仉倩倩前

新虫 (初入文坛)

[求助] 虚拟筛选中靶点的问题 已有1人参与

如果一个蛋白的晶体结构已经解析出来了，现在想要基于此蛋白作为药物靶点做虚拟筛选，但是在PDB数据库中没有该靶点与小分子的结合的晶体结构，只有它与一段肽的结合，请问设置格子的时候可以以肽为中心吗？还是需要其他的方法？希望大神解答！
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1楼 2017-09-21 08:49:26
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apparitioncc

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
正解，就是应当以多肽为中心构建Box
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2楼2017-09-24 08:14:29
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仉倩倩前

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by apparitioncc at 2017-09-24 08:14:29
正解，就是应当以多肽为中心构建Box

不过在薛定谔里可以以肽段为中心构建BOX吗？
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3楼2017-09-25 20:46:14
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