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fengduyanyu新虫 (正式写手)
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引物设计问题,求助。不同的标准序列。
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我做的是动物病毒的PCR扩增,现在准备根据一个全长1100左右的ORF扩增200-300的片段。 现在我在NCBI上查到4个标准毒株,或者说发表的比较早的,全基因的毒株,分别标记为A、B、C、D 我采用Premier6.0进行设计引物,4个毒株参数一致的情况下,分别得到一个评分最高的引物。记为A1、B2、C3、D4。 现在的问题就是,我采用NCBI的 premier-blast去验证,用A1引物可以扩增A、C;B2引物可以扩B、D。C3只能扩C。D可以扩A和D 所以,我想知道的,我该如何取舍引物?还是全部都合成拿去试试。 但是全部合成是否会存在,我无法扩增我分离的地方毒株?而且地方毒株的种类很多,我是处理临床样本去鉴定,会不会存在无法扩增的临床样本。 非常感谢! |
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fengduyanyu
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