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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 软件使用与操作 » auto dock4 不能计算格点能量
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虫小木xrc

新虫 (小有名气)

[求助] auto dock4 不能计算格点能量 已有1人参与

小分子含有不常见的金属原子，对接不能计算格点能量是什么原因。

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1楼 2017-09-05 09:06:17
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虫小木xrc

新虫 (小有名气)
GPF> receptor_types A C HD N OA P         # receptor atom types
GPF> ligand_types A Cl Ir OA N            # ligand atom types
unknown ligand atom type Ir
add parameters for it to the parameter library first!

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2楼2017-09-05 09:08:49
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虫小木xrc

新虫 (小有名气)
auto dock4 不能计算格点能量

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3楼2017-09-05 11:24:26
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虫小木xrc

新虫 (小有名气)
像adt文件中默认的有铱，铜，铁金属，铂的没有，是不是要添加一下铂，请问怎么添加

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4楼2017-09-05 17:35:45
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虫小木xrc

新虫 (小有名气)
像adt文件中默认的有铱，铜，铁金属，铂的没有，是不是要添加一下铂，请问怎么添加

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5楼2017-09-05 17:35:56
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apparitioncc

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
# Non H-bonding atom_par Pt 2.75 0.080 12.000 -0.00110 0.0 0.0 0 -1 -1 1
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6楼2017-09-05 17:39:24
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