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玄玄子

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 转录组测序 已有1人参与

请问大家做完普通转录组测序后，接下来怎么分析啊？我看了差异基因上调下调有不少，但我实在不知道怎么选了，谁做过有经验的帮忙指点指点！

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坚持不下去了就再坚持一下
1楼 2017-09-05 02:26:55
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Nitara

新虫 (正式写手)
看你需要什么基因了 如果有模式生物可以比对就和模式生物比对后筛选一些可能基因 如果没有的话 那就只能系列分析了

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2楼2017-09-05 09:01:13
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玄玄子

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Nitara at 2017-09-05 09:01:13
看你需要什么基因了 如果有模式生物可以比对就和模式生物比对后筛选一些可能基因 如果没有的话 那就只能系列分析了

我做的是肿瘤细胞的RNA，分析下来有几百个差异基因（和对照细胞相比），我想知道怎么去选择这些差异基因中的一些来验证，因为这里面没有什么明星基因，所以我不知道最终该选择可能的信号通路？

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3楼2017-09-05 11:38:44
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分子我

新虫 (初入文坛)
主要还是关注这些基因功能 哪些你感兴趣

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4楼2017-09-05 20:06:19
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玄玄子

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 分子我 at 2017-09-05 20:06:19
主要还是关注这些基因功能 哪些你感兴趣

好的。那么挑选了几个认为合适的基因之后我该怎么办往下呢？是找它们参与的信号通路还是单独拉出来再研究啊？谢谢了，真不懂了....

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5楼2017-09-05 20:41:09
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小小cm

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

105135292这个群里都是研究这些差异基因的，可以问问看
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6楼2018-02-02 13:38:23
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