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qcl龍

铜虫 (初入文坛)

[求助] Lammps模拟,VMD显示原子发生重叠 已有1人参与

lammps用的是EAM力场跑的Pt体系

units                        metal
boundary                p p p
atom_style                full

read_data                Pt55.data

region                        all block 0 40 0 40 0 40
group                        all region all

pair_style  eam
pair_coeff  * * ptu3.eam

neighbor                2.0 bin
neigh_modify                every 10 delay 0 check yes

velocity                 all create 300.0 1234 rot yes dist gaussian

fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 0.1

dump                        1 all atom 1000 dump.lammpstrj

run                        500000

Lammps模拟,VMD显示原子发生重叠
SL(I)T}T`J1P6MX05K_A[6Q.png
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匿名

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2楼2017-09-02 16:58:14
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qcl龍

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xmc057711 at 2017-09-02 16:58:14
先换个势看看。不行看下in文件,atom style用atomic看看。还没跑通的文件不要那么大尺寸和时间。

这些方法都试过了,换个势结果类似,atom style换成atomic出现no bonds allowed with this atom style的错误,你有Pt的EAM势文件吗?
3楼2017-09-02 17:50:52
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qcl龍: 金币+8, ★★★很有帮助 2017-09-02 21:02:25
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4楼2017-09-02 18:09:18
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