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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » NCBI下载序列
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jiuhongse

新虫 (初入文坛)

[交流] NCBI下载序列

大家好，我从NCBI下了基因序列想用于比对及进化等分析，但下载的序列中有Y字母，分析时报错（存在非碱基序列），无法往下进行，这种的怎么弄呢？有经验的帮个忙，谢谢~
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1楼 2017-08-23 17:39:29
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luoyl210

新虫 (著名写手)
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你是不是下载的氨基酸序列啊

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2楼2017-08-23 17:52:55
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jiuhongse

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by luoyl210 at 2017-08-23 17:52:55
你是不是下载的氨基酸序列啊

是核酸序列啊   我网上查了下，说Y代表C或T，但不知道往下怎么处理才能用
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3楼2017-08-23 18:07:06
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luoyl210

新虫 (著名写手)
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引用回帖:
3楼: Originally posted by jiuhongse at 2017-08-23 18:07:06
是核酸序列啊   我网上查了下，说Y代表C或T，但不知道往下怎么处理才能用...

那可以测序的时候就那样

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4楼2017-08-23 18:36:56
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圣地大学

新虫 (小有名气)
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你可以总蛋白序列啊

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5楼2017-08-23 23:47:26
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五一长假

铜虫 (小有名气)
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做比对的  把Y全部替换成C或T中的一个   这个其实对你的进化分析没什么影响      或者    把含有Y的那一列全部删掉           这是个人观点和建议
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6楼2017-09-11 16:54:01
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叫我扬子鳄

银虫 (小有名气)
★
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建议对比与进化分析使用氨基酸序列
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7楼2017-09-19 17:05:48
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