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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS中将单斜晶系转为正交晶系
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)

[求助] MS中将单斜晶系转为正交晶系 已有2人参与

如何在MS中将单斜晶系转为正交晶系？如附件的晶胞，如何转换为正交晶系？
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    • 2017-08-13 21:36:07, 24.34 K

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1楼 2017-08-13 21:37:25
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by xmc057711 at 2017-09-07 19:41:07
x 3 0 0  y 3 5 0 z 0 0 1   变换后第三个角为90.593°，也具有周期性。另外，推荐一个视频，单斜晶系的近似正交化： http://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1004199002

具体怎么变换？谢谢你
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11楼2017-09-07 20:23:16
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get-it

新虫 (小有名气)
扩根号2的超胞可以得到一个接近正交的晶格
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2楼2017-08-14 11:07:01
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by get-it at 2017-08-14 11:07:01
扩根号2的超胞可以得到一个接近正交的晶格

可以具体一点吗？不知道如何下手，谢谢你
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3楼2017-09-03 09:31:07
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get-it

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

Build->Symmetry->Redefine lattice
把矩阵改为 1 1 0；-1 1 0；0 0 1
就是根号2的超胞
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4楼2017-09-04 11:02:05
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by get-it at 2017-09-04 11:02:05
Build->Symmetry->Redefine lattice
把矩阵改为 1 1 0；-1 1 0；0 0 1
就是根号2的超胞

谢谢你
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5楼2017-09-07 10:59:35
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by get-it at 2017-09-04 11:02:05
Build->Symmetry->Redefine lattice
把矩阵改为 1 1 0；-1 1 0；0 0 1
就是根号2的超胞

我想的是晶胞长度尺寸不变，只对晶胞角度和原子坐标进行转换，这样怎么做？
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6楼2017-09-07 11:12:24
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get-it

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 梁水清浅 at 2017-09-07 11:12:24
我想的是晶胞长度尺寸不变，只对晶胞角度和原子坐标进行转换，这样怎么做？...

那样的话结构不是变了吗
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7楼2017-09-07 15:08:27
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梁水清浅

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by get-it at 2017-09-07 15:08:27
那样的话结构不是变了吗...

谢谢你，按照您的方法转换，发现不是正交晶系，三个角度不都是90度，求指教？
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8楼2017-09-07 15:27:08
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匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
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9楼2017-09-07 19:41:07
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匿名

用户注销 (正式写手)
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10楼2017-09-07 20:03:12
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