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armigera

金虫 (正式写手)

[交流] 生物和数学问题 已有2人参与

课题和细胞信号传导有关，结合单细胞成像技术，研究信号通路之间的基因表达变化。目前导师想朝模型上做，实验室和我都是纯生物背景，肯定是要和其他组合作的。恳请虫友帮忙解惑～
1。生物数学模型的前景如何？这是我博士期间课题，基本决定了未来的方向，为了这个课题我需要了解很多数学知识，要把数学分析，线代，统计，微分方程捡起来。如果前景不乐观，我可以趁早跳出来。
2。如果需要补数学，大家有没有推荐的方法？需要学到什么程度？
谢谢～

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1楼 2017-08-11 17:53:22
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风织云锦

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
个人看法: 前景还好吧，现在多数学者说是做生物数学但还是偏数学方向。非常缺乏跟生物专业的结合，主要就是用微分方程模拟生物系统的作用过程，到最后又归结到数学问题上了。国内现今以生物数学命名的研究方向基本上都是用微分方程来做的。如果你能用数学模型来解决你们真正的生物问题，我觉得还是非常棒的！

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2楼2017-10-05 11:15:19
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armigera

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 风织云锦 at 2017-10-05 11:15:19
个人看法: 前景还好吧，现在多数学者说是做生物数学但还是偏数学方向。非常缺乏跟生物专业的结合，主要就是用微分方程模拟生物系统的作用过程，到最后又归结到数学问题上了。国内现今以生物数学命名的研究方向基本上 ...

谢谢回复。
我从文献中了解到，其实这个领域的很多大牛都是先提出了生物学问题，然后用生物实验来验证或者得到一些参数，比如解离常数，最大产生速率之类的。然后根据这些参数，列出微分方程（往往都是常微分方程）来解释得到的生物学现象。并用matlab或者mathmetica等软件来对方程plot，得到的函数图像与实验结果一致。
这样的话，是不是不用把数学学的很专阿？
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3楼2017-11-28 07:06:18
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yyy0305

至尊木虫 (著名写手)
★
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Kenakin T P. A pharmacology primer: theory, applications, and methods‎[J]. Academic Pr Inc, 2009.

这本书里面有很多生物和数据联系起来的内容，可以参考下。

我从事医药行业多年，个人觉得生物如果能化学原理，数学模型结合起来，应该是能够起到非常好的指导意义的，不过这个对实验数据的准确和精密度要求挺高的，科研院所实验数据的精密度和准确度要求这块个人觉得比起医药研发行业还是比较欠缺的
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4楼2017-11-28 09:15:14
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风织云锦

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by armigera at 2017-11-28 07:06:18
谢谢回复。
我从文献中了解到，其实这个领域的很多大牛都是先提出了生物学问题，然后用生物实验来验证或者得到一些参数，比如解离常数，最大产生速率之类的。然后根据这些参数，列出微分方程（往往都是常微分方程 ...

你说的这个其实现在有一个专门的学科叫系统生物学来描述的，数学模型有常微分，偏微分还有随机微分方程，这个方面属于真正的跨学科领域，如果想做这个方面的话，数学功底还是要扎实的，毕竟并不是所有的现象都用常微分就能搞定的

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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

armigera
5楼2017-11-28 11:21:52
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armigera

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 风织云锦 at 2017-11-28 11:21:52
你说的这个其实现在有一个专门的学科叫系统生物学来描述的，数学模型有常微分，偏微分还有随机微分方程，这个方面属于真正的跨学科领域，如果想做这个方面的话，数学功底还是要扎实的，毕竟并不是所有的现象都用常 ...

非常同意。曾经看到过一个观点，数学背景的科学家做系统生物学往往很难提出有意义的生物学问题，生物背景的科学家做系统生物学往往容易只局限于一种数学模型。看来这个方向要求真的很高啊！
我现在的课题就是在研究基因的动态表达变化，比如给个刺激，然后记录它的表达变化曲线，然后用Michaels Menten动态方程往里套数据列出一堆微分方程给出数学解释。感觉在数学方面并没有什么有意义的创新。请大神帮忙指点几个有意思的数学方向。
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6楼2017-11-28 17:59:08
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armigera

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yyy0305 at 2017-11-28 09:15:14
Kenakin T P. A pharmacology primer: theory, applications, and methods‎. Academic Pr Inc, 2009.

这本书里面有很多生物和数据联系起来的内容，可以参考下。

我从事医药行业多年，个人觉得生物如果能 ...

那请问，您需要比较深的数学基础来研究目前的课题么？
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7楼2017-11-28 18:01:08
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yyy0305

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by armigera at 2017-11-28 18:01:08
那请问，您需要比较深的数学基础来研究目前的课题么？...

我是做应用的，精深的数学模型没有涉及多少。

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8楼2017-11-28 19:20:40
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