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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于蛋白保守区域分析
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1937mcq

金虫 (初入文坛)

努力后生

[求助] 关于蛋白保守区域分析 已有2人参与

嗯 ，可不可以请哪位大神可以告诉我，分析蛋白序列的保守区域用哪个网站可以，？？？？注意不是预测跨膜结构域哟，而是保守区域。。小女子万分感谢
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心若向阳，无谓悲伤！
1楼 2017-08-08 19:35:03
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-08-09 07:47:58
你在NCBI将你要分析的序列以fasta格式保存下来，用bioedit自带的clusterW，或者下载clusterX对序列进行对位排列即可。
先把你的viridiplantae这个种属的目标蛋白质序列从NCBI里面提取出来，然后放到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/docs/cdd_search.html 这里面搜索，就能显示你蛋白质的各个结构域。
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及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-08-08 23:28:26
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demonhb

新虫 (小有名气)
http://pfam.xfam.org或者楼上说的CDD数据库都可以，我会两个都跑下看看

发自小木虫Android客户端
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3楼2017-08-08 23:41:08
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baolingmu123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你试试这个网站  http://meme-suite.org/tools/meme
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4楼2017-09-01 22:02:15
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JYL_zero

新虫 (小有名气)
MEME或者NCBI都可以

发自小木虫IOS客户端
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5楼2022-01-05 20:14:15
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