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YF_Gong

铁虫 (小有名气)

[求助] 求推荐分子对接准备配体时涉及的软件及教程 已有1人参与

各位老师 大家好!

近期刚刚接触分子对接,查了很多资料但是仍有一些疑问,主要是关于配体准备方面的

目前我是从SCIFinder上去找化合物的结构,然后用 MarvinSketch 进行平面结构绘制 保存为mol格式文件 进行分子对接。

但是很多材料说要将配体分子先转化为3D结构的 并做MM能量优化才能用

就想问一下 如何转化为3D结构 如何做优化呢?

可否推荐几个软件或者教程?

不胜感激!
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没有梦想,和咸鱼有什么区别?!
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yilanding

木虫 (著名写手)

很傻
2楼2017-07-19 12:46:45
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YF_Gong

铁虫 (小有名气)

内容已删除
没有梦想,和咸鱼有什么区别?!
3楼2017-07-19 14:00:25
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yilanding

木虫 (著名写手)

chemoffice的一个,小木虫上找吧

发自小木虫IOS客户端
很傻
4楼2017-07-19 14:35:05
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

内容已删除

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2017-07-19 20:10:29
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Ericimb

新虫 (初入文坛)

Swiss modeling on line molecular docking server

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-07-21 08:40:20
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YF_Gong

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yilanding at 2017-07-19 14:35:05
chemoffice的一个,小木虫上找吧

多谢多谢
没有梦想,和咸鱼有什么区别?!
7楼2017-07-24 09:55:13
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YF_Gong

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by zh1987hs at 2017-07-19 20:10:29
小胖子,我帮你弄啊~~~...

发现了小胖子的马甲
没有梦想,和咸鱼有什么区别?!
8楼2017-07-24 09:55:41
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YF_Gong

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Ericimb at 2017-07-21 08:40:20
Swiss modeling on line molecular docking server

这个网站不是用来同源建模的么 也可以用么?
没有梦想,和咸鱼有什么区别?!
9楼2017-07-24 09:56:11
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
YF_Gong: 金币+5 2017-08-17 14:19:59
引用回帖:
9楼: Originally posted by YF_Gong at 2017-07-24 09:56:11
这个网站不是用来同源建模的么 也可以用么?...

不可以,swissdock可以,是个在线的服务器
10楼2017-07-25 08:34:53
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