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xiaosi208

木虫 (小有名气)


[交流] 关于NEB做HER表面催化氢化反应的讨论

请问,用NEB做HER表面催化氢化反应时,是否一定要考虑到水溶液条件下进行?按照机理走的话,是需要水的参与的,但如果只是单纯采用H原子进行模拟反应过程,只是做出了Tafel反应机制的能垒,但是Heyrovsky机理却一直模拟不出来,吸附在表面上的单个H原子很容易从表面脱离,很难模拟出中间过程,请问各位大神有何办法能够解决此类问题?
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xiaosi208(金币+1): 谢谢参与
xiaosi208: 回帖置顶 2017-07-21 18:00:46
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流 2017-07-21 20:20:33
vasp有vaspsol的插件,qe有environ插件,这些插件提供了连续介质模型(隐式溶剂模型)。你需要再加上少许直接参与反应的水分子(显式溶剂模型)以及水合质子来处理Heyrovsky机理。刘智攀老师的文章你可以参考下 J. Phys. Chem. C 2013, 117, 7669−7680,采用了连续介质模型(他们自己修改了SIESTA的代码)与三个水分子合一个质子。

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29楼2017-07-20 05:52:54
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)



xiaosi208(金币+1): 谢谢参与
好运
22楼2017-07-19 08:49:42
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xiaosi208

木虫 (小有名气)


送红花一朵
引用回帖:
29楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-07-20 05:52:54
vasp有vaspsol的插件,qe有environ插件,这些插件提供了连续介质模型(隐式溶剂模型)。你需要再加上少许直接参与反应的水分子(显式溶剂模型)以及水合质子来处理Heyrovsky机理。刘智攀老师的文章你可以参考下 J.  ...

好的,谢谢您,您提的建议我会好好考虑,还有刘智攀老师的文章,我也会好好研究研究,非常感谢
33楼2017-07-21 18:00:18
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xiaosi208

木虫 (小有名气)


送红花一朵
引用回帖:
29楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-07-20 05:52:54
vasp有vaspsol的插件,qe有environ插件,这些插件提供了连续介质模型(隐式溶剂模型)。你需要再加上少许直接参与反应的水分子(显式溶剂模型)以及水合质子来处理Heyrovsky机理。刘智攀老师的文章你可以参考下 J.  ...

好的,谢谢您,您提的建议我会好好考虑,还有刘智攀老师的文章,我也会好好研究研究,非常感谢
34楼2017-07-21 18:00:38
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
34楼: Originally posted by xiaosi208 at 2017-07-21 18:00:38
好的,谢谢您,您提的建议我会好好考虑,还有刘智攀老师的文章,我也会好好研究研究,非常感谢...

Matthew Neurock组的文章你也可以研究一下,大家的方法大同小异。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

35楼2017-07-21 19:07:29
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xiaosi208

木虫 (小有名气)


送红花一朵
引用回帖:
35楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-07-21 19:07:29
Matthew Neurock组的文章你也可以研究一下,大家的方法大同小异。...

恩恩,我们现在也是处于摸索阶段,采用的NEB方法做的,现在由于着急写文章使用,暂时先不考虑其他方法吧,谢谢您的提点,请问您也是做这方面的吗?是使用的什么方法做的?
36楼2017-07-22 22:21:28
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
36楼: Originally posted by xiaosi208 at 2017-07-22 22:21:28
恩恩,我们现在也是处于摸索阶段,采用的NEB方法做的,现在由于着急写文章使用,暂时先不考虑其他方法吧,谢谢您的提点,请问您也是做这方面的吗?是使用的什么方法做的?...

现在我不做这个了,之前用的是qe。
37楼2017-07-23 14:13:25
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xiaosi208

木虫 (小有名气)


引用回帖:
37楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-07-23 14:13:25
现在我不做这个了,之前用的是qe。...

恩恩,好的,谢谢您
38楼2017-07-23 15:13:09
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zxcv4041011

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
36楼: Originally posted by xiaosi208 at 2017-07-22 22:21:28
恩恩,我们现在也是处于摸索阶段,采用的NEB方法做的,现在由于着急写文章使用,暂时先不考虑其他方法吧,谢谢您的提点,请问您也是做这方面的吗?是使用的什么方法做的?...

楼主,问题解决了没
39楼2017-12-28 10:35:21
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简单回复
psylhh2楼
2017-07-18 22:02   回复  
xiaosi208(金币+1): 谢谢参与
祝福
wzpmw5643楼
2017-07-18 22:05   回复  
xiaosi208(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2017-07-18 22:07   回复  
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wxmsha315楼
2017-07-18 22:08   回复  
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atbjscs716楼
2017-07-18 22:13   回复  
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avenwb8489楼
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zbexcp85810楼
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wvqhuz1815楼
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mhqzn89523楼
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nono200932楼
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