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fairyzhen

铜虫 (初入文坛)

[求助] 你好,我用天根试剂盒提细菌total RNA,同一批提取的R... 已有3人参与

你好,我用天根试剂盒提细菌total RNA,同一批提取的RNA跑电泳总有一些降解的,要怎么办呢?有一些提出来的有两条带,没有5s RNA ,为什么 @天使托

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萌萌蜕变

新虫 (小有名气)

RNA降解是比较正常的情况,因为空气中会有RNA酶,只能通过操作尽量减少降解一般避免不了。高品质的RNA一般没有5s的条带,而且28s/18s亮度比为2:1左右是比较好的样品,一般这个程度可以继续下步实验。

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2楼2017-07-12 21:25:15
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fairyzhen

铜虫 (初入文坛)

谢谢你的回复,我后续要做转录组,对RIN要求高,三条带不才是完整的高品质的RNA吗 @天使托

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3楼2017-07-13 21:51:31
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傲娇小丫头

新虫 (小有名气)

要做转录组测序,你可以直接送样本到公司,公司提取,这样好一些啊。

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一万年太久,只争朝夕。。。。。
4楼2017-07-24 00:39:12
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傲娇小丫头

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 傲娇小丫头 at 2017-07-24 00:39:12
要做转录组测序,你可以直接送样本到公司,公司提取,这样好一些啊。

转录组测序要求的RNA质量会很高,基本上自己提取很难达到要求,你可以直接送样,公司提取如何让公司反馈提取结果。

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一万年太久,只争朝夕。。。。。
5楼2017-07-24 00:40:45
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fairyzhen

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 傲娇小丫头 at 2017-07-24 00:40:45
转录组测序要求的RNA质量会很高,基本上自己提取很难达到要求,你可以直接送样,公司提取如何让公司反馈提取结果。
...

之前是因为公司提的rna量总是不够,所以自己尝试提取

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6楼2017-07-25 16:32:50
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wu188ming

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

您好,您可以考虑使用北京百泰克的TRIpure总RNA提取试剂(TRIZOL),我提的还可以,降解没有那么严重。详情可私聊。
7楼2017-09-08 10:20:36
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

我用qiagen的也试过,有时候就是RNA含量低,这个正常。你可以注意如下几点:用RNAase清除剂,喷洒操作台。用细菌RNAase抑制剂加入到提好的RNA样品减缓降解。第一步裂解时加入的裂解液稍微多一点,时间久一点。无菌操作,带口罩帽子,避免管口对着超净台外侧。小心每一步操作,DNAase1那步尽可能快!
8楼2017-09-08 13:47:03
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fenggeshj

新虫 (小有名气)

你用的是DP405吗?如果是用于高通量测序的实验,最好还是用DP424,这款提取的产物量会大很多。
9楼2018-01-03 13:19:32
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回首萧瑟123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-09-08 13:47:03
我用qiagen的也试过,有时候就是RNA含量低,这个正常。你可以注意如下几点:用RNAase清除剂,喷洒操作台。用细菌RNAase抑制剂加入到提好的RNA样品减缓降解。第一步裂解时加入的裂解液稍微多一点,时间久一点。无菌操 ...

可以不加dna酶吗

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10楼2019-10-18 23:46:30
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