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小白刚上手一天,有些问题想请教一下
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我看到文献里有人用MS来模拟,我就下载下来用了一下。 我先用其他化学绘图软件,画了个12个氨基酸的环肽,分子量在2000左右,保存成mol格式,然后用MS打开,这都是可以的。 我想做的是,想模拟下两个环肽之间的相互作用力情况比如氢键。 建好结构式模型以后,应该把它放到晶胞里对吧?(今儿刚学的,不确定)我建好了一个最简单的1P1空晶胞,想把结构式粘进去,它告诉我不是非周期性的,可我想设置的时候发现,非周期性那个选项是灰色的不能选呀。(下图二)应该怎么办啊!!!! 然后我又试着用forcite优化一下结构,也跳出来一个错误??(如图一)这怎么解决呢。 发自小木虫IOS客户端 |
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