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拓海行空

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,怎么分析内含子? 已有1人参与

有cDNA序列,有含内含子的全长序列,怎么分析内含子?用什么软件?要分析哪些内容?

发自小木虫IOS客户端
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

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拓海行空: 金币+5, ★★★很有帮助 2017-07-14 10:42:00
1、建议你利用软件进行预测 http://linux1.softberry.com/berry.phtml

2、具体分析方法就看你想做什么研究了。

3、外显子是编码序列,内含子不参与编码,会在转录过程中的加工去除。
内含子和外显子的分界线在于:GU-AG法则.即每个内含子的开始两个碱基都是是GU(或GT),最后两个是AG。
在NCBI等网站里下载到的序列里,已经大部分帮你标注好了exon(XX ..XX),intron(XX ..XX).不用你自己找了。
及时行乐,人生不留遗憾!
2楼2017-07-12 14:33:07
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