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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 请问大神，在做AUTODOCK分子模拟时为什么要删除水分子，...
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chenjm0215

木虫 (正式写手)

[求助] 请问大神，在做AUTODOCK分子模拟时为什么要删除水分子，... 已有1人参与

请问大神，在做AUTODOCK分子模拟时为什么要删除水分子，水分子可能在酶底物识别中具有关键作用，这点不是很明白，求大神指点。 @smutao

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1楼 2017-07-10 10:00:29
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chenjm0215: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2017-07-20 15:42:44
对接是个理想的环境，不考虑溶液,PH等因素
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2楼2017-07-11 17:50:59
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谁家那小孩

木虫 (正式写手)
做对接的时候需要去除溶剂化

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追随时间的脚步实现他日的梦想
3楼2017-07-11 20:13:27
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changjun

铜虫 (著名写手)
如果水起关键作用，就不要删除。一般的教程中之所以删除水是因为在那些案例中水不起作用。

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天然产物、药物开发
4楼2017-07-16 07:00:20
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塘沽特

新虫 (正式写手)
如果水起重要作用就不要删除了，水会占据口袋位置影响对接结果，答案仅出于个人理解

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5楼2018-01-21 11:21:05
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