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zyh_echo

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么确定一株已分离得到的菌是新菌株??? 已有4人参与

近期通过分离得到一株双歧杆菌,已经进行16s rDNA测序,并已在BLAST进行比对,相似性为99%。
这种结果是不是就已经确定了我所分离得到的这株菌不是新菌株,还是需要再做一些相关实验来确定?
如果想要通过这株菌申请一些专利,还需要补充哪些方面的一些数据?比如益生特性方面的?
谢谢。
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浮生若茶520

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
99%一般不是新株,98%以下有很大可能是,确定新株要买模式菌,做碳源氮源,GC含量,DNA杂交试验,极性脂等
2楼2017-07-06 10:38:24
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
99%的话应该不算是新菌株吧~申请专利的话也不一定非得是新菌株,只要某些特性足够突出就可以了吧~
···
3楼2017-07-06 12:25:48
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破网

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首先,我觉得你应该分清楚两个概念:新菌和新菌株。这么说吧,你分离出来的,肯定是新菌株,但不一定是新菌。
16S是新菌的一个参考,但不是绝对的,金标准应该是DNA杂交。99%以上,也可能是新菌。
go
4楼2017-07-07 12:38:09
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

99%不一定是新“种”,也不一定不是新“种”,可以测基因组草图,然后用MicrobeTrakr进一步鉴定一下,或者你直接找microbetrakr帮你鉴定是新种的可能性。用的方法是基因组学的DNA杂交,金标准
5楼2017-07-07 14:22:16
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iwanfeng

新虫 (小有名气)

想问下双歧培养的厌氧设备 你们是用厌氧罐吗

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-07-24 13:23:51
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