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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 怎么确定一株已分离得到的菌是新菌株？？？
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zyh_echo

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么确定一株已分离得到的菌是新菌株？？？ 已有4人参与

近期通过分离得到一株双歧杆菌，已经进行16s rDNA测序，并已在BLAST进行比对，相似性为99%。
这种结果是不是就已经确定了我所分离得到的这株菌不是新菌株，还是需要再做一些相关实验来确定？
如果想要通过这株菌申请一些专利，还需要补充哪些方面的一些数据？比如益生特性方面的？
谢谢。
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1楼 2017-07-04 10:27:47
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浮生若茶520

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
99%一般不是新株，98%以下有很大可能是，确定新株要买模式菌，做碳源氮源，GC含量，DNA杂交试验，极性脂等
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2楼2017-07-06 10:38:24
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
99%的话应该不算是新菌株吧~申请专利的话也不一定非得是新菌株，只要某些特性足够突出就可以了吧~
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···
3楼2017-07-06 12:25:48
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破网

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首先，我觉得你应该分清楚两个概念：新菌和新菌株。这么说吧，你分离出来的，肯定是新菌株，但不一定是新菌。
16S是新菌的一个参考，但不是绝对的，金标准应该是DNA杂交。99%以上，也可能是新菌。
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go
4楼2017-07-07 12:38:09
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

99%不一定是新“种”，也不一定不是新“种”，可以测基因组草图，然后用MicrobeTrakr进一步鉴定一下，或者你直接找microbetrakr帮你鉴定是新种的可能性。用的方法是基因组学的DNA杂交，金标准
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5楼2017-07-07 14:22:16
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iwanfeng

新虫 (小有名气)
想问下双歧培养的厌氧设备 你们是用厌氧罐吗

发自小木虫IOS客户端
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6楼2017-07-24 13:23:51
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