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汕头大学海洋科学接受调剂
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lty子于

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] Lammps中氮气和氧气的建模及in文件怎么写 已有1人参与

比如N2分子中两个N原子分别带-0.5075e电荷和N原子相对分子质量,两个N原子连线中心有一个带+1.0150e,没有质量的dummy atom,N-N键长1.098埃,应如何建模并在lammps的in文件中如何实现?
O2分子更复杂一些,两个O原子只有质量,电荷分布在两个O原子连线中垂线上,其中两个O原子连线中间带+4.2e电荷,中垂线距带正电中心0.2埃处各带电-2.1e,应该如何建模并通过lammps计算?先谢谢大家。

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cl1994861

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
lammps中貌似实现不了这么复杂的功能,什么电荷分布,,,等并没有这个命令好像。键长倒是可以指定,这么复杂的情况建议用其他软件辅助吧,比如material studio等
2楼2017-07-03 17:15:31
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lty子于

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cl1994861 at 2017-07-03 17:15:31
lammps中貌似实现不了这么复杂的功能,什么电荷分布,,,等并没有这个命令好像。键长倒是可以指定,这么复杂的情况建议用其他软件辅助吧,比如material studio等

谢谢你的回复。我好像也没找到这种命令,请问你知不道lammps能不能能添加dummy atom呢? 我在想,1、能不能通过建模去实现。 2、如果lammps不能实现dummy atom添加,那模拟N2这样的带偶极的分子在lammps中应该如何去实现?

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3楼2017-07-04 09:38:37
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cl1994861

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lty子于 at 2017-07-04 09:38:37
谢谢你的回复。我好像也没找到这种命令,请问你知不道lammps能不能能添加dummy atom呢? 我在想,1、能不能通过建模去实现。 2、如果lammps不能实现dummy atom添加,那模拟N2这样的带偶极的分子在lammps中应该如何 ...

这个我也不清楚,不太懂。。。
4楼2017-07-04 15:42:10
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lty子于

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cl1994861 at 2017-07-04 15:42:10
这个我也不清楚,不太懂。。。...

嗯嗯,还是谢谢你的回答啦

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5楼2017-07-05 15:20:51
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hnfn

新虫 (初入文坛)

hello,楼主请问你现在建好了氧气和氮气的模型吗?可以分享一下么?我正好现在要用到这个,感觉很多参数都不确定啊。
6楼2018-07-12 16:05:12
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lty子于

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hnfn at 2018-07-12 16:05:12
hello,楼主请问你现在建好了氧气和氮气的模型吗?可以分享一下么?我正好现在要用到这个,感觉很多参数都不确定啊。

lammps里没法按上面说的这么建

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7楼2018-07-13 13:59:53
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tavyk1

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hnfn at 2018-07-12 16:05:12
hello,楼主请问你现在建好了氧气和氮气的模型吗?可以分享一下么?我正好现在要用到这个,感觉很多参数都不确定啊。

你好   氧气您会建模了吗
8楼2018-11-26 17:51:50
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lty子于

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by tavyk1 at 2018-11-26 17:51:50
你好   氧气您会建模了吗...

不能那么建

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9楼2018-11-27 07:59:04
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luyaobao

木虫 (著名写手)

挺复杂的,可能需要改源代码,可以参考tip4p的实现,其中有电荷就用到了dummy atom

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10楼2018-11-27 10:11:06
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