| 查看: 1486 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
zbbrian木虫 (初入文坛)
|
[求助]
求助：RNAfolding 预测及解读 已有1人参与
|
|
|
本人并非生信出生，因为实验需要另补部分mRNA结构预测及分析的数据。自己摸索半天最后在Vienna RNA web上进行了RNA分析，但是给出的数据着实让我一头雾水，请大神指点。 在输入序列后给出的Results for thermodynamic ensemble prediction 结果如下 The free energy of the thermodynamic ensemble is -240.54 kcal/mol. The frequency of the MFE structure in the ensemble is 0.00 %. The ensemble diversity is 253.71. minimum free energy = -227.90 kcal/mol 我尝试从给出的参考文献中查找，但是仍不清楚这几个参数具体表征什么，数值大小意味着RNA在折叠过程中有什么特性？ 附件中dot plot 是一种整体 base pair的图？ 最后给出mountain plot 有mFR，pf和centroid三个参数，对应着我所有的碱基位置，具体每个碱基数值的高低是指代什么？如果改变了其中几个碱基，数值改变又意味着什么呢？ 不好意思一口气问了这么多，希望有大神耐心回答，  金币可以追加么？  dot-plot.png  mountain plot.png |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有265人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
fengshen2005
银虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2622.9
- 散金: 50
- 红花: 5
- 帖子: 518
- 在线: 80.2小时
- 虫号: 2251556
- 注册: 2013-01-20
- 专业: 免疫学
4楼2017-07-06 06:34:13
2楼2017-07-05 18:53:03
zbbrian
木虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2027.8
- 散金: 672
- 帖子: 37
- 在线: 75.4小时
- 虫号: 1987125
- 注册: 2012-09-09
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
3楼2017-07-05 22:29:25
xushengpan
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2890.8
- 红花: 1
- 帖子: 79
- 在线: 70.8小时
- 虫号: 607058
- 注册: 2008-09-19
- 专业: 电化学分析
5楼2019-07-24 13:17:09
40