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hanjun80

金虫 (正式写手)

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发酵大害:噬菌体

2017-01-17 生物工程面面观
老样子,先说噬菌体是啥捏?
非典病毒大家都知道吧?那就是病毒,侵染人的病毒。要是放在古代的话,那就是瘟疫了。噬菌体也是病毒,那逗是细菌的瘟疫啊!!!

早在一百多年前,有些嗅觉很灵敏的科学家们就已经意识到了噬菌体的存在了。那时候,印度的人们还处于大小便进河沟、从河沟里面舀一碗水就喝的年代,霍乱时不时地就爆发一次。一个在印度出差的英国细菌学家 Ernest Hanbury Hankin说,霍乱就是细菌引起的,你们把水烧开了再喝就没事了。但是印度的新闻媒体对这位细菌学家的建议强烈的反对,甚至对他极尽讽刺。看看!新闻、媒体和作家是多么的木有节操啊——对自己一点都不了解的领域,在没有做过任何调查研究的情况下,大放厥词。还是这位Hankin,发现了河水里面有些东西可以透过非常精细的陶瓷过滤器,这些东西可以杀掉引起霍乱的微生物从而抑制霍乱的爆发。20年后,另外一个英国的细菌学家也发现了这种小东西。又过了两年,这个小东西有名字了!一个来自最牛B的微生物学研究机构——法国巴斯德研究所(图1,不是上海那个哦)的科学家Hubert Augustin Félix Haerens在培养微生物的时候,经常悲催的被噬菌体污染,于是他搞到了噬菌体并且给他起了个很凶狠的名字—— bacteriophage ,而且成功的发明了噬菌体疗法。更悲催的是,这小伙当年混的挺惨,在巴斯德所工作的时候是不拿工资的。后来虽然被提名了8次诺贝尔奖,但是一次都没能拿到。尽管年轻时候很衰,但是这小伙还是大器晚成的获得了很多荣誉。所以抱怨起的比鸡早、睡得比鸡晚、干的比鸡多、挣得比鸡少的生物专业的小伙伴们不要灰心啊,说不定啥时候就名扬天下了。



那噬菌体长啥样啊?有请肌尾型噬菌体隆重登场(Caudovirales,有尾型噬菌体,图1),这种噬菌体有些长得十分的体面、讲究、高大上(图2,左1),大名鼎鼎的T4噬菌体就是这幅尊荣了。也有些有尾型噬菌体长得挺磕碜、低小矬(图1,中),大名鼎鼎的λ噬菌体和T5噬菌体就这个熊样。T3、T7和Φ29则是右1这种棒槌似的噬菌体,嗯嗯,棒槌有点不符,大锤似的噬菌体。除了这种大锤型的肌尾型噬菌体以外,还有棍子型的棒状噬菌体(这个是我的命名,英语名字叫Ligamenvirales)和其他一些像雾像雨又像风的形状奇怪的噬菌体。
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图2 有尾型噬菌体;来源于维基百科

但是这些噬菌体绝大多数都是这样一种组成:蛋白质壳子包着点基因组DNA或RNA。噬菌体这东西和病毒一样弱,弱到啥程度捏:噬菌体自己不会生,必须得想办法把基因组放到细菌细胞里面,才能生下一代。而且不是随便找个细菌就能让丫感染的,它只能感染那些特定的、活的、营养状态的细菌,像芽孢那种半死不活的菌,噬菌体还是没办法下口的;稍烫点的水(高温),它被烫死了——就像鸡蛋清一煮就熟了;醋放多了(低pH),它被酸死了——鸡蛋清用高浓度醋泡一下就凝固了;火碱放多了(高pH),他被碱死了——就像松花蛋;来个日光浴(辐射),晒死了;喝点酒(酒精),醉死了;天气干燥点,干死了;经常接触不到宿主,饿死了;空气里面带一点甲醛、氯、臭氧,都可以让噬菌体痛不欲生。所以,这东西还是很弱的。

那人们就问了,它这么弱,为啥还这么难除呢?君不知,它虽然弱,可是多,可是能生,可是小。如果让一个幸运的噬菌体感染了一个大肠杆菌,几分钟以后它就可以增殖到几十甚至数百个,如果让一个更幸运的噬菌体进了发酵罐,(*@ο@*) !那就是天堂啊,只需要几十分钟时间就可以让整个发酵罐充满了噬菌体子弟兵!用显微镜看的时候,大肠杆菌尸横遍野(刚刚进裂解周期)甚至尸骨无存(完全溶菌)。

要是哪家有发酵业务的公司幸运的污染了噬菌体,那就恭喜了,噬菌体就成了您摇瓶制种、罐上发酵永远的益友了——它可以让您魂牵梦绕、牵肠挂肚、日思夜想、寝食难安。那应该咋解决问题捏?目前的解决方法,就像人得了乙肝一样,暂时无法彻底根治。只能玩了命的镇压,不过这个镇压比乙肝病毒治疗厉害且有效多了:
1)烫死它们:煮了整个罐;
2)饿死它们:停止任何活菌培养,处理掉污染的菌种;
3)熏死它们:用臭氧、用甲醛、用氯气类;
4)照死它们:用紫外;
5)毒死它们:用酒精、用卫可、用84、用新洁尔灭;
6)其他。

说了这么多,避免让自己用的活菌扩散到环境中是防治噬菌体的最重要的办法了,受噬菌体坑害的小伙伴们,加油!!!
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