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791618275

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 结构优化问题FormBX had a problem. 已有1人参与

我优化结构时候输出文件是这样的
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
Bend failed for angle    36 -    53 -    56
Tors failed for dihedral    32 -    36 -    53 -    56
Tors failed for dihedral    37 -    36 -    53 -    56
FormBX had a problem.
Error termination via Lnk1e in /share/apps/g09.D01/g09/l103.exe at Thu Jun 29 09:19:10 2017.
Job cpu time:       5 days 19 hours 14 minutes 18.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    616 Int=      0 D2E=      0 Chk=     56 Scr=      1


36 . 53 56这三个原子成180度了,师兄告诉我把36 53 56这个角度调整一下重新通进去就行了,我想知道这些说的都是什么啊,最好仔细说一下,新手谢谢了..
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7152075

铁杆木虫 (著名写手)

解决问题的方法比遇到的问题多

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
791618275: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢- - 2017-06-30 10:13:36
791618275: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-07-03 15:12:22
这个算是高斯的一个bug,如果优化过程中,二面角成180°的话,会报错。你可以在关键词中加入opt=cartesian,这样就可以避免这个问题了。
Chemistry
2楼2017-06-29 18:40:11
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791618275

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 7152075 at 2017-06-28 22:40:11
这个算是高斯的一个bug,如果优化过程中,二面角成180°的话,会报错。你可以在关键词中加入opt=cartesian,这样就可以避免这个问题了。

加入这个词会有别的影响么

发自小木虫Android客户端
3楼2017-06-30 00:05:49
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

如果是Z矩阵坐标优化,180度键角的B矩阵无法定义;

如果用默认的冗余内坐标优化,180度键角的B矩阵要写成两个正交内坐标的线性组合,导致内坐标的个数增加,因此必须在结构优化一开始就是180度。如果是优化过程中出现或消失了180度角,内坐标个数不一致,就会导致错误。此时只要在出错的地方拿上一次结构继续优化就行。

如果是直角坐标优化,就不会出现上面的问题。但是无法限制一些键长、键角等。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2017-06-30 06:50:14
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7152075

铁杆木虫 (著名写手)

解决问题的方法比遇到的问题多

引用回帖:
3楼: Originally posted by 791618275 at 2017-06-30 00:05:49
加入这个词会有别的影响么
...

大多数情况下,opt=cartesian会增加优化至极小点的步数,如果你的体系耗时还不算太多的话,可以直接用其至优化收敛。
Chemistry
5楼2017-06-30 08:25:57
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791618275

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by beefly at 2017-06-29 10:50:14
如果是Z矩阵坐标优化,180度键角的B矩阵无法定义;

如果用默认的冗余内坐标优化,180度键角的B矩阵要写成两个正交内坐标的线性组合,导致内坐标的个数增加,因此必须在结构优化一开始就是180度。如果是优化过程中 ...

我这个能看出来是什么坐标优化么,我这个应该冗余坐标优化吧!
感觉你说的很高端,B矩阵是什么意思,你说的一开始就要180度这个也没太懂,能不能再详细说一说- -
6楼2017-06-30 10:12:46
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小YY01

新虫 (正式写手)

7楼2017-06-30 10:28:31
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十里青山远

新虫 (初入文坛)

你好楼主,我也遇到了同样的出错信息,请问你问题解决了吗
8楼2019-05-02 12:39:22
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