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rollingveau

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么用molekel画分子轨道图

我用vaspmo得到out文件,导入了molekel里,在计算轨道的时候,还叫我导入out这是怎么回事呀,我弄这个弄的焦头烂额的了,都快对科研没信心了

怎么用molekel画分子轨道图


怎么用molekel画分子轨道图-1


@jiewei 发自小木虫Android客户端
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

看到图片有种特别熟悉的感觉。这是老版的molekel(任何时候点任何窗口的关闭都会导致整个程序退出),我以前有用过Gaussian的计算文件用它来画静电势面图,只有老版的才能画出条状的图形。

回到楼主的问题,vasp 不是很知道,Gaussian的经验来看,是需要先导入结构(out,cube都可以),之后再导入包涵基组波函数的文件,高斯为例是out文件,而且还必须是09版的高斯,我之前用它做计算也的确出现了类似的问题,后来我选择用cube文件解决的,但不是直接的计算了。

我觉得楼主的问题可能也是如此,你可以看看新版的能不能解决你的这个问题,官网直接可以下载。

不要失去信心,总能解决的
2楼2017-06-28 14:25:20
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-06-28 14:25:20
看到图片有种特别熟悉的感觉。这是老版的molekel(任何时候点任何窗口的关闭都会导致整个程序退出),我以前有用过Gaussian的计算文件用它来画静电势面图,只有老版的才能画出条状的图形。

回到楼主的问题,v ...

说错一个地方,必须是03版的高斯out文件,我自己用的09版的,有尝试过转换到03版的,结果还是不行,后面也没深究此问题
3楼2017-06-28 14:26:51
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rollingveau

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-06-28 14:25:20
看到图片有种特别熟悉的感觉。这是老版的molekel(任何时候点任何窗口的关闭都会导致整个程序退出),我以前有用过Gaussian的计算文件用它来画静电势面图,只有老版的才能画出条状的图形。

回到楼主的问题,v ...

需要导入结构和波函数文件两个吗?都是用load导入吗?

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4楼2017-06-28 14:51:06
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rollingveau

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-06-28 14:25:20
看到图片有种特别熟悉的感觉。这是老版的molekel(任何时候点任何窗口的关闭都会导致整个程序退出),我以前有用过Gaussian的计算文件用它来画静电势面图,只有老版的才能画出条状的图形。

回到楼主的问题,v ...

新版本的我也下了,两个版本界面差别太大了,我还没搞懂。

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5楼2017-06-28 14:52:43
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by rollingveau at 2017-06-28 14:51:06
需要导入结构和波函数文件两个吗?都是用load导入吗?
...

应该是吧,好像没有别的方法了!不过如果出现有些数据不识别那就没办法了,因为的确版本问题,它只能识别老版本的格式,Gaussian也是如此。
我也很久没用这软件了,实在太难用了!
6楼2017-06-28 15:05:15
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

看到两个帖子
http://muchong.com/t-1449889-1
http://muchong.com/t-7641098-1
你可以参考下,看能不能解决你的问题

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2017-06-28 16:05:20
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rollingveau

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-06-28 16:05:20
看到两个帖子
http://muchong.com/t-1449889-1
http://muchong.com/t-7641098-1
你可以参考下,看能不能解决你的问题

我知道了,是要在out文件里加一行东西,终于懂了,谢谢你

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8楼2017-06-28 16:43:06
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rollingveau

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-06-28 15:05:15
应该是吧,好像没有别的方法了!不过如果出现有些数据不识别那就没办法了,因为的确版本问题,它只能识别老版本的格式,Gaussian也是如此。
我也很久没用这软件了,实在太难用了!...

对了,我在molekel里面导入的结构,只显示一层,你知道这个是怎么的吗

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9楼2017-07-01 11:34:29
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