24小时热门版块排行榜    

查看: 1161  |  回复: 2

Aiyanan_柚砸

新虫 (初入文坛)

[求助] 新手adsorption模块求助

本人MS新手要做肽聚糖对多环芳烃类物质的吸附模拟,找吸附位点和吸附力,就试着用了adsorption模块,之后可以看到氢键这些作用力,但是不知道怎么量化的表示吸附作用,求解答:
1.写文章的时候怎么表示吸附了?吸附作用位点在哪怎么表示?
2.我在网上和文献了看大家做吸附的好像不怎么使用adsorption模块是为什么?它和forcite模块的区别在哪?是功能比较简单么?
3.或者大神们有没有对于我这个课题有相关的资料或者建议求指点,周围没有做这方面研究的本人自学如果出现了低级的错误还请各位指出,感激不尽

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhiboban

新虫 (初入文坛)

Sorption模块一般用来算吸附量,adsorption模块用来找吸附位点(都是物理吸附)所谓吸附位点一般是指在某个活性位的某个位置,top位 hollow位 bridge位等等,但是涉及到吸附位点一般都是化学吸附,所以那个模块一般用来预测,所以文章里基本没有用这个模块的。他跟Forcite模块相同的地方是原理上都是分子动力学,不同之处就是功能,Forcite一般用来做动力学模拟,比如扩散等。

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-09-28 12:26:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

帽子嘟嘟

新虫 (小有名气)

楼主你好,请问一下你的adsorption lacator是怎么做的?为什么我想做石墨烯上的吸附不行呢?导入adsorbate文件的时候一直提醒我要导入非周期性结构

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2020-02-02 03:23:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Aiyanan_柚砸 的主题更新
信息提示
请填处理意见