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1040768794

木虫 (正式写手)

[求助] cfDNA的保存问题已有3人参与

各位大牛,有知道如何保存提取后的cfDNA,或者是短片段的DNA片段如200bp左右的小片段的方法么?
保存液是选择无核酶水,或者是TE(10mM Tris-HCl,1mM or 0.1mM EDTA?,pH 7.5 or 8.0?),需要添加哪些核酸稳定剂或者抑制剂之类试剂么?
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kissmet

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
1040768794: 金币+20, 有帮助 2017-06-26 10:12:11
你提到的都是可以的 不需要添加别的稳定剂或是抑制剂什么的。
2楼2017-06-23 16:52:48
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1040768794

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kissmet at 2017-06-23 16:52:48
你提到的都是可以的 不需要添加别的稳定剂或是抑制剂什么的。

我们之前做过质粒线性化,然后回收的酶切片段降解很快,一直也没能解决,你有做过这方面的么,不知道有没有什么建议
还有就是如果我们在商业化公司直接合成基因短片段和质粒的线性化酶切产物会有什么区别呢
3楼2017-06-26 10:12:05
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半天云

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

不需要添加特别的抑制剂,一般提取cfDNA的都是用AVE 溶解保存,放在-20℃ 冰箱即可,请问你提取cfDNA的量大概有多少
4楼2017-08-08 09:13:14
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大大女超人

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

2022年4月18日,易基因有关于:基于微量cfDNA甲基化的液体活检如何开展的直播讲座,关注“易基因”视频号或公众号预约看直播
内容:
1、cfDNA甲基化介绍和临床应用场景
2、cfDNA甲基化检测技术现状和瓶颈
3、基于cfDNA甲基化液体活检如何开展
4、cfDNA甲基化技术新品:cfDNA-RBS
主讲人:
王君文   高级技术总监
        易基因合伙创始人
        深圳市高层次人才、坪山区高层次人才
        华大基因研究院表观遗传平台创建及技术研发负责人
        表观基因组学技术专家,从事表观遗传学研究11年,研发创建LHC-BS、HMST-seq、MicroWGBS、MeDIP/ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化测序技术,优化简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞高通量甲基化测序、微量DNA全基因组甲基化,及RNA甲基化高通量测序等技术和方法。
        申请发明专利20余项,授权涵盖中国、欧盟、香港、美国等国家和地区。在《Nature》,《Nature Communications》,《Cell Research》、《Genome Biology》,《Clinical and Translational Medicine》,《Clinical Epigenetics》等国际知名期刊发表30余篇。
5楼2022-04-22 11:33:56
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atikou

铜虫 (小有名气)

cfDNA可以选择用无核酸酶水保存,如果有更好的冷却环境,如-80冰箱等可以更好的保存cfDNA。为助力低样本量多维度分析,深圳易基因开发了富集覆盖CpG岛、启动子、增强子、CTCF结合位点的cfDNA甲基化测序方法——cfDNA-RBS,实现了高灵敏度和样本复用,使其具有高度可扩展性,并适用于有限的样本和单个细胞。
6楼2022-06-30 19:53:44
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