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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】MOF结构如何建立
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)

[交流] 【求助】MOF结构如何建立

有很多计算多空材料MOF（metal–organic framework）的，
我感觉结构比较复杂，晶胞中既有金属原子，还有有机官能团，他们之间相互连接形成关联整体。
这么复杂的结构如何才能准确建立晶体模型呢？
向高手请教！
谢谢！

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-23 at 14:46 ]
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储氢家族欢迎储氢研究者！
1楼 2009-01-16 22:32:19
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)
还有几个样图。
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储氢家族欢迎储氢研究者！
2楼2009-01-16 22:33:26
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lindlar0078

木虫 (著名写手)
是不是直接按照通常建立晶体的方法就行呢？我没有试过！
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一切从头开始！
3楼2009-01-17 13:51:45
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1):鼓励交流！ 1-20 16:07
我正好也很想知道。但是在ConQuest中找不到类似结构，在NIST中也找不到类似的晶体结构。我几乎已经放弃寻找了，想自己建立模型然后优化算了？
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4楼2009-01-17 19:06:37
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派
★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+3):thank you very much! 1-20 16:07
zxzj05(金币+2,VIP+0):xiexie 2-18 10:55
zxzj05(金币+1,VIP+0):xiexie 2-18 10:57
兄弟，每篇文章后面的支撑材料中都有相应的晶体结构图，第二楼的结构应该是yaghi的MOF-5结构图，你找一篇yaghi1999年在nature上的文献，下载她的支撑材料，其中有相关数据，在build》crystal中输入结构类型以及原子位置的数据，就能够得到结构图拉！Good Luck！
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天道酬勤!
5楼2009-01-20 09:37:37
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
找了一下，的确有。
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6楼2009-01-20 19:33:43
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zxzj05(金币+2,VIP+0):xiexie 2-18 10:56
zxzj05(金币+3,VIP+0):xiexie 2-18 10:59
yjmaxpayne(金币+2,VIP+0):谢谢 12-9 21:18
谢谢hjlyyc。
(节选)......  
atom               x            y         z          B,q           occ
Zn(l)        0.293490(9)        0.2065        0.2065        1.701(2)        1/16
0(i)        0.28070(5)        0.2193        0.13387(6)        2.96(2)        1/2
0(2)        0.2500        0.2500        0.2500        1.524(16)        1/24
C(l)        0.2500        0.2500        0.11170(13)        2.50(4)        1/4
C (2)        0.2500        0.2500        0.05377(12)        2.63(4)        1/4
C (3)        0.28248(8)        0.2175        0.02645(10)        4.16(4)        1/2
H(l)        0.3055        0.1945        0.0453        5.1510        1/2
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7楼2009-01-20 20:36:41
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zyj8119

木虫 (著名写手)
兄弟,我也是做MOF的,我的qq:675096471...
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好好学习，天天向上。
8楼2009-01-21 19:20:13
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一条小害虫

铜虫 (小有名气)
弱弱的问？
什么叫支撑材料？
怎么寻找支撑材料？
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9楼2009-01-22 08:42:47
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wzpwzp

金虫 (小有名气)
★
wuchenwf(金币+1):谢谢讨论 1-22 20:56
支撑材料并不是对应的英文词，比如上面的查到的是一个word文件叫"crystallography",直接下载即可。但是根据里面的东西得到的不一定正确，输出来有时是个怪东西，不一定可靠。
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10楼2009-01-22 20:36:25
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