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wenxuan5788

金虫 (正式写手)

[交流] [求助]如何用vasp计算Gd单个原子能量?

请问如何用vasp计算Gd的单个原子能量?INCAR里面如何设置?

[ Last edited by zeoliters on 2009-6-13 at 17:00 ]
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+3):很好,性情中人啊 1-17 21:09
wenxuan5788(金币+3):非常感谢 1-19 08:15
你气死我了。我这很多天都在进行Gd的运算。用了好几个软件,都算不出来。可能是势函数不好。你用VASP居然一下子算出来了。我早就感到VASP可能有戏,但是我没有这个软件啊。

我来告诉你我的看法:
1.你光建立一个大单胞是不行的。你要建几个,比如15*15*15,20*20*20,25*25*25等,分别进行计算,看看能量是不是收敛到一个值,也就是说,看看元胞大到什么程度的时候,不影响计算结果。
2.元胞尺寸定下来以后,再考察K-point,以及能量截断的影响。办法就是多换几个参数去试,直到能量收敛(一般两次计算能量之差不超过1mhar),也就是这些参数不影响能量值为止。因为只算一个原子,应该很快的。
3.最后你应该得到一个你确信的值。

你问Ga、La单原子的能量是多少,这是没法回答你的。因为大家如果用不同的势或者不同的算法去算,结果绝对值可能有很大不同。你只能以如下方式检验你的结果:

A。计算Gd单个原子能量。
B。对Gd晶体进行结构优化(只优化元胞尺寸),并计算Gd晶体中单个原子能量。
C。求得Gd的结合能(cohesive energy)。
如果你的结合能算出来是对的,那么你的单原子能量就是可以使用的。

Gd的结合能Ecoh,文献值一般在4.14~4.18eV,
Gd的结构如下:
空间群:P6 3/mmC (194#),HCP,Mg型,a=3.615ang,c=5.777ang。

以前也有人计算过如下结果:a=6.873Bohr,c=10.897Bohr, Ecoh=4.344eV,给出的实验值则是a=10.902Bohr,c=6.858Bohr。
这篇文章是PRB, 50(1994),1363。
还有一篇文章在PRB,44(1991),7451。你自己查吧。这两篇文章都是用LSDA算的。

对La和其它原子也是同样的处理和检验。对O,可以通过计算O2分子的原子化能来考察计算的有效性。

我以上说的是比较保险的办法,步步检验。当然这样搞的话比较慢一些,而且需要人很勤奋。呵呵

不过根据我的经验,稀土元素在DFT中是很难处理的。所以以上只供你参考。

如果你算出了好的结果,尤其是如果用GGA算出了好的结果,别忘了跟我联系一下,或者发个帖子讲一下你用的势和Gd的计算结果。谢谢。

[ Last edited by 老虎大王 on 2009-1-17 at 20:18 ]
5楼2009-01-17 20:15:18
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xiaomagh

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2):鼓励交流! 1-20 16:09
引用回帖:
Originally posted by wenxuan5788 at 2009-1-19 08:25:
请问INCAR里面该如何设置?我按照候博士讲义里的设置,计算出来的结果,但是感觉不太理想。“对Gd晶体进行结构优化(只优化元胞尺寸),并计算Gd晶体中单个原子能量。”你说的这句话我不太明白,晶体结合能还需要 ...

我来帮着回答一下吧,对于Gd晶格进行结构优化是指的用HCP的结构进行Gd的基态总能量的优化计算,这个计算出来的是Gd在HCP结构下的基态总能量,然后要减去Gd的孤立原子能量,才能得到原子的结合能。
不清楚,再问吧
8楼2009-01-19 23:24:10
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普通回帖

wenxuan5788

金虫 (正式写手)

要计算该能量主要为了计算体系的结合能,请高手详细告诉一下,我对这方面不太懂。谢谢
2楼2009-01-16 13:50:33
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xiaomagh

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+4,VIP+0):xiexie讨论
wenxuan5788(金币+2):谢谢 1-19 08:16
引用回帖:
Originally posted by wenxuan5788 at 2009-1-16 12:29:
请问如何用vasp计算Gd的单个原子能量?INCAR里面如何设置?

楼主说的不是很清楚,可以这么回答你,你要是想获得Gd组成某种结构时,单个原子的能量的话,那么你就将Gd按照某种结构进行建模,比如HCP,BCC, FCC等,然后计算总能量除以原子数目即可。
如果你想计算一个孤立原子的能量的话,那么你就要建立一个很大的包,只放一个原子于其中,比如10angstrom的大包。然后计算能量,建议看一下VASP的user guide 上面有。
3楼2009-01-16 17:33:33
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wenxuan5788

金虫 (正式写手)

我计算的体系是La7Gd1Mo8O36。我想计算一下体系的结合能,我看资料上说需要计算单个原子的能量。我计算Gd单个原子能量的步骤是:先建立一个大的单包:15X15X15。只放一个Gd原子,然后计算能量。我计算结果是-0.210eV,我觉得不太对,请问Gd,La的单个原子能量一般是多少?
4楼2009-01-17 16:09:07
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
wuchenwf(金币+2):xiexie讨论 1-17 21:09
补充:
我以上说的是,在你没有你的体系(La7Gd1Mo8O36)的结合能实验值的情况下,你可以用这个方法来确立你对计算结果的信心。
如果你有La7Gd1Mo8O36的结合能实验数据,那就简单了,只需一股脑计算La、Gd、Mo、O的单原子能量,以及La7Gd1Mo8O36的晶体总能量就可以了,一下子算出结合能,跟实验值一比就行了。
6楼2009-01-17 20:24:56
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wenxuan5788

金虫 (正式写手)

请问INCAR里面该如何设置?我按照候博士讲义里的设置,计算出来的结果,但是感觉不太理想。“对Gd晶体进行结构优化(只优化元胞尺寸),并计算Gd晶体中单个原子能量。”你说的这句话我不太明白,晶体结合能还需要计算Gd晶体中单个原子能量吗?我看文献上说结合能的计算方法是:
晶体总能——(单个原子能量*原子个数)。

[ Last edited by wenxuan5788 on 2009-1-19 at 08:45 ]
7楼2009-01-19 08:25:29
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
fegg7502(金币+2):鼓励交流! 1-20 16:09
楼上回答的是对的。
结合能=晶体中每个原子的能量-孤立的单个原子能量。


我说的晶体中的单个原子能量,就是指晶体能量,但由于元胞设置问题,故而强调是平均到每个原子的能量。


你列出的公式也是对的。即晶体总能-孤立的单个原子能量×晶体中原子个数。显然这两个公式结果相差n倍,n=晶体中原子个数。 但一般所说的结合能的量纲是 能量/每原子。

DFT计算,有意义的不是能量绝对值而是相对的能量值。你算出来的晶体能量和孤立原子能量的值都不重要,关键是二者之差是否符合实验值。

[ Last edited by 老虎大王 on 2009-1-20 at 12:02 ]
9楼2009-01-20 11:59:43
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wenxuan5788

金虫 (正式写手)

老虎, 我计算的结果不怎么理想,我把我计算的结合能始终是负值。
10楼2009-02-11 09:29:41
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