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筱林士人

金虫 (著名写手)

[求助] 只知道一个基因名称,如何在NCBI中找到这个基因的序列 已有1人参与

只知道一个基因名称,如何在NCBI中找到这个基因的序列,并且需要找到和自己所需要的近缘物种的基因序列,请各位大神指导一下呀
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stabilized

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-06-18 22:51:29
如果你要找的是一个物种的某个基因,而此物种被上传过,直接搜试试,需要仔细浏览,下载此基因FASTA文件;
如果你有A物种基因组(没被上传过),想研究A物种的某个基因,就按照下面的方法
步骤:
1.NCBI中输入你找的基因名称,选择一个你需要的基因(最好是A物种的近亲), 下载此基因FASTA文件。
2.在NCBI中下载A物种的基因组,用BioEdit软件把刚才的基因(FASTA)在你的基因组中比对出来,比对出来的就是A物种的这个基因。
前提:
1.A物种近亲是那些
2.BioEdit会使用
坚持!
2楼2017-06-16 17:37:43
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筱林士人

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stabilized at 2017-06-16 17:37:43
如果你要找的是一个物种的某个基因,而此物种被上传过,直接搜试试,需要仔细浏览,下载此基因FASTA文件;
如果你有A物种基因组(没被上传过),想研究A物种的某个基因,就按照下面的方法
步骤:
1.NCBI中输入你 ...

最大的问题是我不知道它近缘物种有哪些,我通过分类学找到的这个科和属的物种都没有相关的基因序列,麻烦请教一下,有啥办法找这个物种的近缘物种吗
3楼2017-06-18 16:36:07
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宁文峰

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 筱林士人 at 2017-06-18 16:36:07
最大的问题是我不知道它近缘物种有哪些,我通过分类学找到的这个科和属的物种都没有相关的基因序列,麻烦请教一下,有啥办法找这个物种的近缘物种吗...

文献,

发自小木虫Android客户端
所追求的不在明天,而在现在以前
4楼2017-06-18 17:48:07
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stabilized

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 筱林士人 at 2017-06-18 16:36:07
最大的问题是我不知道它近缘物种有哪些,我通过分类学找到的这个科和属的物种都没有相关的基因序列,麻烦请教一下,有啥办法找这个物种的近缘物种吗...

只能一点点看文献了。。。
坚持!
5楼2017-06-18 20:58:27
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

输入基因名字,查找基因序列,就这么简单。

发自小木虫Android客户端
6楼2017-06-18 21:51:51
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梦与命

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stabilized at 2017-06-16 17:37:43
如果你要找的是一个物种的某个基因,而此物种被上传过,直接搜试试,需要仔细浏览,下载此基因FASTA文件;
如果你有A物种基因组(没被上传过),想研究A物种的某个基因,就按照下面的方法
步骤:
1.NCBI中输入你 ...

您好,我想请教一下近缘种的标准是什么呢?必需是同属的吗?
7楼2019-09-10 11:42:59
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