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【GULP错误报告】Coulomb subtraction not allowed
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本人博一，岩土专业，在做Na-montmorillonite的分子模拟，研究hydration和力学性质。正常来讲，使用molecule关键词就可以去掉共价键原子间的库伦力。然而却遇到以下错误信息： ERROR : Coulomb subtraction within periodic molecules is not allowed 体系主要状况是：cell里面有820个原子，包含粘土的晶体和水层以及水中的正离子。以下是.gin文件的主要部分： # Keywords: opti nosym full conp distance angle bond compare prop # Structure(s): cell 20.692124 17.912804 24.272009 91.882561 98.519024 89.959525 fractional 。。。原子位置，种类，lj势函数的参数略。。。 # Molecular dynamic parameters temperature 300.000 ensemble npt 0.1 0.1 timestep 0.001 ps equilibration 2.0000 ps production 8.0000 ps sample 0.001 ps write_MD 0.001 ps lennard epsilon geometric inter all # 所有原子之间的lj势 0.0 9.0 # lj势的范围 harmonic bond intra # 水分子原子间的弹簧势 Oh H 48.0591 1 Hs H 48.0591 1 Ow Hw 48.0591 1 three bond intra regular Ow Hw Hw 3.969515 109.47 # 水分子键角相关的势 cutp 9.0000 1.0000 # 势函数cutoff radius rtol 1.3 # bond length tolerance switch_min rfo gnorm 0.005000 。。。文件输出啥的略。。。 |
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