应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于lammps计算配位数问题
51/1返回列表
查看: 2880  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

折翼的飞鸟

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于lammps计算配位数问题

请问我的这个计算配位数的问题，输出总是报错，该怎么输出呢？
compute             coord  workpiece   coord/atom  cutoff  1.0  3  1*3
dump                2  workpiece  custom  100  si1.lammpstrj  id  type  x  y  z  c_coord
ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector (../dump_custom.cpp:1363)
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-06-15 10:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你这个error已经提示了，说compute不能计算per-atom vector啊，还有配位数不是径向分布函数的积分？这个是后来的数据处理的事么，能够直接输出出来么
赞一下 回复此楼
2楼2017-06-15 10:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

折翼的飞鸟

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cl1994861 at 2017-06-15 10:53:58
你这个error已经提示了，说compute不能计算per-atom vector啊，还有配位数不是径向分布函数的积分？这个是后来的数据处理的事么，能够直接输出出来么

文献里有一个工件根据配位数着色的问题，这个应该是算出来的。我把后面的1*3删了，可以输出。顺便请教个问题，就是compute     coord  workpiece   coord/atom  cutoff  1.0  3  1*3，我这个命令后面的3  1*3，这是原子类型3给原子类型1*3贡献吗？还是怎样？有点懵
赞一下 回复此楼
3楼2017-06-15 11:23:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个我也不太清楚，我也没用过这个命令。。。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2017-06-15 14:35:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

牛很牛

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
还有一个疑问就是截断距离是1埃吗？如果是的话，这么小的距离，怎么可能得到一个配位数
赞一下 回复此楼
5楼2019-07-02 16:47:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 折翼的飞鸟 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭