应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于lammps计算配位数问题
51/1返回列表
查看: 2678  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

折翼的飞鸟

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于lammps计算配位数问题

请问我的这个计算配位数的问题，输出总是报错，该怎么输出呢？
compute             coord  workpiece   coord/atom  cutoff  1.0  3  1*3
dump                2  workpiece  custom  100  si1.lammpstrj  id  type  x  y  z  c_coord
ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector (../dump_custom.cpp:1363)
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-06-15 10:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你这个error已经提示了，说compute不能计算per-atom vector啊，还有配位数不是径向分布函数的积分？这个是后来的数据处理的事么，能够直接输出出来么
赞一下 回复此楼
2楼2017-06-15 10:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

折翼的飞鸟

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cl1994861 at 2017-06-15 10:53:58
你这个error已经提示了，说compute不能计算per-atom vector啊，还有配位数不是径向分布函数的积分？这个是后来的数据处理的事么，能够直接输出出来么

文献里有一个工件根据配位数着色的问题，这个应该是算出来的。我把后面的1*3删了，可以输出。顺便请教个问题，就是compute     coord  workpiece   coord/atom  cutoff  1.0  3  1*3，我这个命令后面的3  1*3，这是原子类型3给原子类型1*3贡献吗？还是怎样？有点懵
赞一下 回复此楼
3楼2017-06-15 11:23:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cl1994861

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个我也不太清楚，我也没用过这个命令。。。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2017-06-15 14:35:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

牛很牛

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
还有一个疑问就是截断距离是1埃吗？如果是的话，这么小的距离，怎么可能得到一个配位数
赞一下 回复此楼
5楼2019-07-02 16:47:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 折翼的飞鸟 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 309求调剂 +5 花与叶@ 2026-03-10 5/250 2026-03-16 14:13 by 哦哦123
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 328，0703考生求调剂，一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 云南财经大学信息学院计算机学硕专硕学位点 +3 zjptai 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:23 by 飞行琦
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 327求调剂 +4 Ffff03 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:17 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 研究生招生 +3 徐海涛11 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:26 by 徐海涛11
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭