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含笑~

银虫 (正式写手)

[交流] 260/280值,DNA含量与agarose条带?

所提取4个样品的基因组DAN,260/280分别是1.8597,1.7247,1.7908,1.7387,含量(ug/ul)分别是:0.0690,0.1849,0.2098,0.1939(BECKMAN DU800)
可跑0.6% agarose时,只有第一和第三个样品有条带,但比较弱,不知原因何在,如果说是DNA含量太低,第一个样品的量是最低的,第二,三,四几乎无差别的呀,为何第二 第四个样品无条带?Marker: -HIND III 50ng/ul 含量比我的样品高很多倍,这有没影响。
260/280值,DNA含量与agarose条带有必要关系吗?
请大家帮分析分析,先谢过大家!

[ Last edited by 含笑~ on 2009-1-15 at 09:54 ]
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含笑~

银虫 (正式写手)

谢谢SUTAO1979:
1 含量(ug/ul)分别是:0.0690,0.1849,0.2098,0.1939就是DNA的浓度
2 基因组DNA大于5000bp,所以用0.7%以下的胶
3 我是想知道DNA含量和纯度都相近的情况下,为何有二个跑不出条带,今天重跑了,还是没条带
4楼2009-01-15 22:38:15
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

★ ★
lwf991229(金币+2,VIP+0):3Q`
1.如果你的凝胶成像仪待分析功能的话,你可以和marker(一般是50ng/ul,上样量一致)比一下亮度,这样就大概知道了DNA的浓度了
2.OD的比值测得是纯度,根据公式得出浓度
3.你的agrose gel浓度有点大,可以试一试1-2%
4.在没有参照的情况下,DNA的浓度和eb染色的agrose gel发光率没有必然联系
会当凌绝顶,一览众山小
3楼2009-01-15 21:52:26
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

最有可能的就是你的浓度测得不准,再重新测一下,然后把胶的浓度提高
DNA比值在1.8左右是最好的
会当凌绝顶,一览众山小
5楼2009-01-16 04:23:36
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含笑~

银虫 (正式写手)

再次谢谢sutao!昨天已经联系分光光度计的工程师了,正在等待中....:)不过不解的是:5000bp以上的DNA用0.6%的agarose 没问题的,marker 跑得很好,为何要提高胶浓度?
6楼2009-01-16 10:26:53
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