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阳yang洒洒

新虫 (初入文坛)

[求助] Trizol法提取的RNAA260/280比值低于1.8,怎么回事??或是怎么可以进一步纯化 已有1人参与

Trizol法提取的象甲触角RNA,A260/280比值一直低于1.8,不懂是哪一步有问题。我严格按照上面的步奏进行,每次提取的上清液有体积要求吗?或是怎么可以进一步纯化?

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吕玉平

新虫 (初入文坛)

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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励热心回帖交流 2017-06-21 22:52:48
280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。
A230 测定其它碳源物质,如酚,糖类等;
A260 是核酸的吸收峰测 RNA 和 DNA,引物等的浓度用的;
A280 是蛋白质的吸收峰。
一般的,我们只看 OD260/OD280(Ratio,R)——1.8~2.0时,我们认为 RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当用 Tris 作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于 2(一般应该是<2.2的)。当 R<1.8时,溶液中蛋白或者其他有机物的污染比较明显,你可以根据自己的需要决定这份RNA 的命运。当 R>2.2时,说明 RNA 已经水解成单核酸了。 纯RNA 的A260/A280的比值为 2.0。
OD260/OD230的比值还表明 RNA 的纯度——其值 <2.0 表明裂解液中有亚硫氰胍和β-巰基乙醇残留,其值   >2.4,需用乙酸盐,乙醇沉淀 RNA。
每天的目标就是过的充实
2楼2017-06-12 15:57:45
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吕玉平

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励热心回帖交流 2017-06-21 22:52:30
附:
260/230的值,一般不要小于2.0,小的话表明有异硫氰酸胍,β-巯基乙醇或乙醇的残留。补救的方法是再沉淀一次,然后重复乙醇洗涤的过程。但从我的经验看,后面RNA丢得很多……因此提RNA时就注意了

个人经验,260/230偏小的话,提取时可以改进以下几点:
1.加氯仿抽提后取少一点上清,不要贪多。
2.加乙醇洗的时候,多晃几次,尽量让RNA沉淀整片悬浮起来(有时候确实浮不起来也没办法。)
3.弃乙醇的时候,用枪吸而不是倾倒,倒的话经常有液滴留在管壁上,倒不干净。第一次用蓝枪头吸,可以不完全吸干,免得吸到沉淀;然后短暂离心把残余酒精甩到管底,看准了用白枪头尽量吸干净。RNA量大,被白枪头弄掉一点也没关系。
4.溶解前晾干的时间可以长一点,5分钟也没关系的。标准的做法说是不能晾太久,等沉淀开始变透明就要加水溶解,但是我晾过10分钟的,后面RNA量也很大。可能量大,虽然有些溶解不了,最后浓度还是高。

可能不完全正确,但是以前我出现过260/230偏小的问题,按上面方法改进了操作,后面就好了。

还有一种原因可能是多糖类杂质残留,可试试用LiCl沉淀。
RNA溶液的OD260/230的比值在0.2左右,参考资料显示这个比值应该在2.0附近。我觉得你可能根本没有提出rna,按理说有蛋白污染之类的话也不会如此之低。
每天的目标就是过的充实
3楼2017-06-12 15:59:26
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阳yang洒洒

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 吕玉平 at 2017-06-12 15:57:45
280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。
A230 测定其它碳源物质,如酚,糖类等;
A260 是核酸的吸收峰测 RNA 和 DNA,引物等的浓度用的;
A280 是蛋白质 ...

我的是A260/280一直很低,我吸的上清液很少,我加的是氯仿抽提,我需要改成酚氯仿吗?或是我需要加什么其它的试剂进行纯化?

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4楼2017-06-13 09:26:59
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吕玉平

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 阳yang洒洒 at 2017-06-13 09:26:59
我的是A260/280一直很低,我吸的上清液很少,我加的是氯仿抽提,我需要改成酚氯仿吗?或是我需要加什么其它的试剂进行纯化?
...

我看到一些资料显示利用Trizol法抽提的RNA溶于DEPC水后的260/280的值介于1.6-1.8。http://www.doc88.com/p-2357393285700.html你去这个网页上查看一下,另外,RNA可以用电泳检测一下,如果18s和28s条带很亮无降解或降解很少很少,基本上可以往下接着做实验了。

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每天的目标就是过的充实
5楼2017-06-14 09:46:50
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阳yang洒洒

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送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 吕玉平 at 2017-06-14 09:46:50
我看到一些资料显示利用Trizol法抽提的RNA溶于DEPC水后的260/280的值介于1.6-1.8。http://www.doc88.com/p-2357393285700.html你去这个网页上查看一下,另外,RNA可以用电泳检测一下,如果18s和28s条带很亮无降解或 ...

提RNA时,我将氯仿改成酚:氯仿:异戊醇=25:24:1,加异丙醇是也加入1/2高盐溶液,这样可行吗?

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6楼2017-06-21 21:51:56
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