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jiuhongse新虫 (初入文坛)
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共线性 已有1人参与
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| 大家好，从头测序的基因组scaffold序列与参考染色体序列进行共线性分析的时候，是用mummer直接比对获得共线性区域呢，还是先用mauve对齐到染色体序列后再用mummer比对呢，看文献都有呢，到底哪个更合适点呢？还有同时找到重排后怎么分析其断点特征呢？谢谢` |
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2楼2017-11-06 19:25:53
3楼2018-01-13 09:48:56
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请问用mummer的mummerplot画图以后用gnuplot输出以后的图不懂怎么分析，比如红色是正向匹配，蓝色，还有没有形成线性而且一些零散的点说明两个序列间相似性很差是吗？ 发自小木虫Android客户端 |
4楼2019-07-24 20:34:48