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高分子在碳酸钙表面的吸附模拟
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我在试着用低版本的MS中的Discover模块模拟高分子在碳酸钙表面的吸附,模型就是将构建好的聚合度为10的高分子复制粘贴在晶体的表面(真空层50埃),然后将表面固定后进行Minimizer和Dynamics,现在有两个问题没办法解决了: 1、小木虫有前辈说,高分子与晶面的初始距离的确定是刚好产生Moniter close contacts就好,但我发现,微调这个距离或者翻转高分子,得到的吸附能有时会有几百cal/mol的差别。我想问这个初始距离以哪个距离为准?还有翻转高分子也使吸附能变化,感觉得到的吸附能不太可信,怎么用在论文里? 2、在开始对碳酸钙晶胞进行切面之前,碳酸钙的原始结构用不用优化一下再用?(之前在CASTEP模块计算晶体表面能时,晶体的原始晶胞要优化一下,始终不明白这个优化是什么作用) 希望有经验的前辈能给点建议,谢谢! |
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