24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

sbingyi

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 5470.9
红花: 1
帖子: 673
在线: 293.6小时
虫号: 2647093
注册: 2013-09-11
性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] 求助，Material Studio 8.0 Cluster 提交多机作业无法计算

Material Studio 8.0 Cluster 已经配置好 Torque 调度系统，并能提交并计算单机作业（14核或者28核，集群双路cpu，每cpu 14核）。
但是提交多机作业（大于28核或者大于14核分配到不同节点上）时，会一直卡住，没有任何的输出，也没有新文件生成。

我弄了好几天了，怀疑是 Licences 的问题，多机计算时无法授权 Linceses，想请教大家一下。

提交了一个多机的 DMol3 作业，终止之后检查应该是卡死在

引用回帖:

Run: /opt/accelrys/MaterialsStudio8.0/bin/perl /opt/accelrys/MaterialsStudio8.0/etc/Gateway/root_default/dsd/servers/DMol3.pl -standalone -fromdsd fromdsd.txt -todsd todsd.txt

而 todsd.txt 文件如下

引用回帖:

1496842082 status new setup
1496842082 status new starting
1496842083 status new queued
1496842085 progress -1
1496842088 status new running
1496842767 status new stopping
1496842775 progress 100
1496842775 message error Application finished with no output file GeP3-5L-1.outmol
1496842776 status new failure-completed

很明显在status new running 之后就卡住了，而一直过了700s 被我终止掉才出现stopping

对比运行成功的单机版输出

引用回帖:

1496842481 status new setup
1496842481 status new starting
1496842482 status new queued
1496842484 progress -1
1496842488 status new running
1496842489 message License checkout of MS_dmol successful
1496842489 message License checkout of MS_dsolid successful
1496842498 intermediate file GeP3-5L-1.car
1496842498 intermediate file GeP3-5L-1.monitor
1496842503 message SCF converged
1496842508 intermediate file GeP3-5L-1.car
1496842508 intermediate file GeP3-5L-1_opt.summ
1496842508 intermediate file GeP3-5L-1.monitor

可以发现是立即出现 License successful。

除了交互式的提交，我使用命令行，用2机2核也会卡死在 DMol3.pl -standalone -fromdsd fromdsd.txt -todsd todsd.txt 而无任何输出而单机就能立即算出

这可以说明是Lincese的原因吗，还是说是其他的问题，论坛里有人知道Cluster 的Lincense 如何正确的安装吗 (我是从网上随便找的License)

这个问题已经困扰我好几天了，搜遍了安装文档和网上，也不知道 Cluster 和Lincense 的正确安装方式

集群信息如下

集群有master 登录节点，node 1-8 计算节点，在master上安装好 Material Studio 8.0 后，通过nfs共享给 node 1-8
master 端口是18889

master配置信息