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新虫 (初入文坛)

[求助] build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题

尊敬各位虫友:
      大家好,MS新手,向各位请教一个build layer使用问题。

      目的:希望建立PDMS(聚二甲基硅氧烷)与铜界面模型,分析其抗拉强度。具体操作:
                1.使用脚本建立PDMS交联后的模型并退火弛豫选择最优构型,记录最后晶胞参数。
                2.使用cleave工具切割铜(1 1 1)表面,修改U/V参数,使得铜表面大小和PDMS模型晶胞参数基本一致。
                3. 使用Build layer工具搭建二者界面模型,具体设置如附图所示。
       遇到问题: 1.根据上述操作步骤,搭建模型出现PDMS边界被切割现象(display style不是in-cell),原来的PDMS聚合链被切断,出现大量的未成
                                 键的单独氢原子。
                         2.对被切割界面进行几何优化后(先把基底铜固定),聚合物并不向金属铜靠拢,而是分散开来,向上部真空层中扩散,下图给出了几何优化
                           后的构象。被切割的界面(图)几何优化后构象,与表面未被切割的界面(图)几何优化后的构象。
                         3. 被切割表面的模型无法进行下一步的拉伸试验,因为聚合物分散开来,感觉很不合理。
      希望得到的帮助:希望各位大神指出我的问题所在,指出如何正确建立出不被切割的PDMS-铜界面。

build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题
buildlayersetting1.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-1
buildlayersetting2.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-2
buildlayersetting3.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-3
期望建立的界面模型侧视图.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-4
期望建立的界面模型俯视图.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-5
切割铜表面设置1.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-6
切割铜设置2.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-7
实际建立的界面模型侧视图.png


build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-8
实际建立的界面模型俯视图.png
build layer聚合物与铜界面搭建后,聚合物表面被切割问题-9
未成键氢原子.png
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leahxuan

金虫 (正式写手)

您好,请问您的问题解决了吗?
2楼2017-11-08 16:18:01
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李坤龙201212

新虫 (初入文坛)

您好,请问您的问题解决了吗?
3楼2021-05-26 19:45:15
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