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迷糊hh

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大牛指导16srDNA测序结果 已有2人参与

16S rDNA做出来的ABI和seq的文件,打开的图是这样的,表示完全看不懂,求指导

求大牛指导16srDNA测序结果


求大牛指导16srDNA测序结果-1


求大牛指导16srDNA测序结果-2


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曲水流

新虫 (正式写手)

2楼2017-06-03 23:51:54
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qhuaxmchong

新虫 (小有名气)

一般你只需要包含序列信息的seq文件。这个图是告诉你测序质量的。

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3楼2017-06-04 00:32:40
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巴萨女铁粉vq

新虫 (著名写手)

4楼2017-06-04 08:29:59
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雪白的双子

木虫 (正式写手)

这个是测序的原理,不是重点

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5楼2017-06-04 15:28:04
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不懂事的我

新虫 (正式写手)

峰图表明你的样品序列稳定与否,如果是纯菌应该就不会出现非常突兀的峰,做拼接比对是不用看峰的,只要序列就可以,正反向序列拼接到一起然后去掉引物,就可以在NCBI上比对了

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6楼2017-06-05 16:04:03
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bbass533

禁虫 (小有名气)

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7楼2017-06-05 16:29:34
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bbass533

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

13楼2017-06-06 11:26:49
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by bbass533 at 2017-06-05 16:29:34
16s测序,你应该是双向测序吧?公司没有给你拼接序列文件么?拿那个文件进行blast就可以了。
峰图给你是为了告诉你测序质量如何,是不是信号弱、双峰什么的。不用太纠结啦,你这个测序还算可以

您的意思是,只看最后的报告的结果就行是么?

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8楼2017-06-05 20:14:05
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 曲水流 at 2017-06-03 23:51:54
发过数据来,要建进化树?

谢谢您,我不是学生物的,我们老师发我的让分析,有测序报告,但实在不知道该怎么分析

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9楼2017-06-05 20:17:33
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 巴萨女铁粉vq at 2017-06-04 08:29:59
这个图发文章是不需要的吧

谢谢您

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10楼2017-06-05 20:18:11
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