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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 求大牛指导16srDNA测序结果
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大牛指导16srDNA测序结果 已有2人参与

16S rDNA做出来的ABI和seq的文件，打开的图是这样的，表示完全看不懂，求指导

求大牛指导16srDNA测序结果


求大牛指导16srDNA测序结果-1


求大牛指导16srDNA测序结果-2


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1楼 2017-06-03 19:34:50
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曲水流

新虫 (正式写手)
发过数据来，要建进化树？

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2楼2017-06-03 23:51:54
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qhuaxmchong

新虫 (小有名气)
一般你只需要包含序列信息的seq文件。这个图是告诉你测序质量的。

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3楼2017-06-04 00:32:40
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巴萨女铁粉vq

新虫 (著名写手)
这个图发文章是不需要的吧

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4楼2017-06-04 08:29:59
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雪白的双子

木虫 (正式写手)
这个是测序的原理，不是重点

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5楼2017-06-04 15:28:04
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不懂事的我

新虫 (正式写手)
峰图表明你的样品序列稳定与否，如果是纯菌应该就不会出现非常突兀的峰，做拼接比对是不用看峰的，只要序列就可以，正反向序列拼接到一起然后去掉引物，就可以在NCBI上比对了

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6楼2017-06-05 16:04:03
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bbass533

禁虫 (小有名气)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
7楼2017-06-05 16:29:34
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bbass533

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
13楼2017-06-06 11:26:49
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普通回帖

迷糊hh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bbass533 at 2017-06-05 16:29:34
16s测序，你应该是双向测序吧？公司没有给你拼接序列文件么？拿那个文件进行blast就可以了。
峰图给你是为了告诉你测序质量如何，是不是信号弱、双峰什么的。不用太纠结啦，你这个测序还算可以

您的意思是，只看最后的报告的结果就行是么？

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8楼2017-06-05 20:14:05
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 曲水流 at 2017-06-03 23:51:54
发过数据来，要建进化树？

谢谢您，我不是学生物的，我们老师发我的让分析，有测序报告，但实在不知道该怎么分析

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9楼2017-06-05 20:17:33
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迷糊hh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 巴萨女铁粉vq at 2017-06-04 08:29:59
这个图发文章是不需要的吧

谢谢您

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10楼2017-06-05 20:18:11
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