| 查看: 4762 | 回复: 1 | ||
[求助]
如何查找基因组中有特定功能的基因 已有1人参与
|
|
求助，我想在NCBI上某种真菌R.i的基因组中查找具有arsenate reductase功能的基因，我该怎么检索呢？很多序列没有明确的基因名称和功能只是在注释中推测是“arsenate reductase like”，如何检索到基因组中推测有该功能的基因呢？困扰了我好久了，希望各路大神帮帮忙。 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
拉坦前列腺素(Latanoprost)：前列腺素F2α衍生物如何成为青光眼一线用药
已经有0人回复
-
卟啉家族中的明星分子：MESO-四(3,5-二溴-4-羟基苯基)卟啉的性质与制备
已经有1人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有196人回复
-
宠物寄生虫防治：氟雷拉纳阻断GABA受体，持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
-
为呼吸打开通道：依伐卡托的科学之旅
已经有1人回复
-
Dordaviprone（ONC201）：小分子药物在中线胶质瘤中的应用
已经有0人回复
-
依喜替康：新型喜树碱衍生物的研究进展
已经有1人回复
-
膀胱癌靶向治疗新选择：厄达替尼作用机制与耐药研究进展
已经有0人回复
-
从水母到实验室：腔肠素的发现历程与生物发光奥秘
已经有1人回复
-
线粒体氧化磷酸化的新靶点：S-Gboxin的发现与研究进展
已经有0人回复
-
PROTAC药物开发选择VHL配体：MDK-7526以87%出口向量占有率成首选
已经有0人回复
nanhu1984
银虫 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 2251.2
- 散金: 13
- 红花: 13
- 帖子: 701
- 在线: 245.4小时
- 虫号: 2531775
- 注册: 2013-07-04
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
| 做BlastP比对分析，先收集一些砷还原酶基因序列作为数据库，然后将真菌基因比对这个数据库，最后手工筛选即可！可以参考一下本人的文章：Genomic Evidence Reveals the Extreme Diversity and Wide Distribution of the Arsenic-Related Genes in Burkholderiales (http://journals.plos.org/plosone ... urnal.pone.0092236) |
2楼2017-06-01 15:05:59