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如何查找基因组中有特定功能的基因 已有1人参与
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求助，我想在NCBI上某种真菌R.i的基因组中查找具有arsenate reductase功能的基因，我该怎么检索呢？很多序列没有明确的基因名称和功能只是在注释中推测是“arsenate reductase like”，如何检索到基因组中推测有该功能的基因呢？困扰了我好久了，希望各路大神帮帮忙。 发自小木虫Android客户端 |
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nanhu1984
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
| 做BlastP比对分析，先收集一些砷还原酶基因序列作为数据库，然后将真菌基因比对这个数据库，最后手工筛选即可！可以参考一下本人的文章：Genomic Evidence Reveals the Extreme Diversity and Wide Distribution of the Arsenic-Related Genes in Burkholderiales (http://journals.plos.org/plosone ... urnal.pone.0092236) |
2楼2017-06-01 15:05:59