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bluelz_2001

银虫 (初入文坛)

[交流] 奇怪的现象:pet28质粒双酶切线后电泳,比环状的跑的还快

在用pet28a做重组表达
提取了pet28a空载的质粒后,用EcoR I和Sal I做双酶切
发现空载质粒双酶切后,反而比未切的对照跑的快
做50 ul和20 ul酶切都出现了这种情况,就用10 ul体系做了双、单酶切效果的对照

图中是10 ul体系,EcoR I和Sal I双酶切和单酶切后的电泳图
Lane 1: pet28 空载质粒(未切)
Lane 2: pet28 质粒EcoR I和Sal I双酶切
Lane 3:pet28 质粒EcoR I单酶切
Lane 4:pet28 质粒Sal I单酶切

双酶切体系是
10 ul
质粒 3 ul
10*H缓冲液 1 ul
EcoR I 0.5 ul
Sal I 0.5 ul
水 5 ul

单酶切体系是
10 ul
质粒 3 ul
10*H缓冲液 1 ul
EcoR I 或 Sal I 0.5 ul
水 5.5 ul

划板-摇菌活化-提质粒-酶切-电泳,重复了多次,电泳出来的效果都是这样,而且用双酶切后回收的质粒与我的目的基因连接转化,虽然kana抗性的平板上长出了克隆,但筛选不出阳性的。另外,EcoR I和Sal I购自takara,从pMD克隆载体上切我的目的片段没有问题。

还请大家帮忙给分析一下,多谢 多谢!!
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

★
bluelz_2001(金币+1,VIP+0):及时回答了我的问题
转化的时候做上切好的空质粒的对照,然后根据结果判断。如果对照也长了很多说明没有切开,进一步考虑酶切的问题。筛不到很有可能就是质粒没有切好。如果酶切的和没有切的用的都是一个样本,那么电泳的问题先不考虑(为什么超螺旋的质粒那么少)。
金币是赌出来的
2楼2009-01-12 16:16:08
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