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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求助 利用MS构建SI型水合物笼型结构
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水货之路

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助 利用MS构建SI型水合物笼型结构 已有1人参与

建模过程如下：
1.利用文献中空间群，晶格参数和H原子与氧原子的位置建立SI型笼型水合物的构型。
2.建模结果一个O上面有四个H，一个C原子上有8个H
求大神告诉原因, 谢谢，金币只有这么多的

求助 利用MS构建SI型水合物笼型结构
123.jpg


求助 利用MS构建SI型水合物笼型结构-1
234.png


求助 利用MS构建SI型水合物笼型结构-2
456.png
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1楼 2017-05-24 15:46:33
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水货之路

新虫 (初入文坛)
自己先顶一下，看了很多帖子，有相关的，但是都没有给出怎么解决的方法，希望别沉下去
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2楼2017-05-24 15:48:39
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水货之路

新虫 (初入文坛)
有帖子说：消除对称性 然后删除多余的氢原子 最后在优化。
问题是这样怎么知道删除哪个氢原子，优化后是不是笼型结构
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3楼2017-05-24 16:39:55
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lywal

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

取消对称，然后删掉多余的氢，把氧原子固定再做优化
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4楼2017-07-14 11:25:20
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123zxj890

新虫 (初入文坛)
楼主，可以发一下论文的题目吗？谢谢你~一直找不到元素的坐标

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5楼2018-01-16 20:31:22
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囧态

新虫 (小有名气)
请问如何构建这个结构，我看的文献没有这部分具体方法

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6楼2018-09-12 08:48:50
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信小毅

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 水货之路 at 2017-05-24 15:48:39
自己先顶一下，看了很多帖子，有相关的，但是都没有给出怎么解决的方法，希望别沉下去

这个问题解决了吗？
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7楼2018-10-13 15:42:53
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