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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 【求助】能否用分子模拟方法模拟纳米粒子与生物分子的结合？
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libaosun

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】能否用分子模拟方法模拟纳米粒子与生物分子的结合？

小弟欲做这方面的实验，但还想以数值模拟的方法在这方面做一些东西，以便于比较。不知道分子模拟方法能不能研究这方面的问题？如果可以那么需要用什么软件，什么方法？我现阶段对分子模拟了解很少，还望各位大牛不吝赐教!
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1楼 2009-01-10 15:07:55
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yzhhlq_1983

木虫 (正式写手)
★ ★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与！
libaosun(金币+1,VIP+0):多谢你的帮助，祝新年快乐！
可以是可以的，但是对于你的这个体系，在分子模拟中体系可能会很大，计算会很耗时。除非你不考虑溶剂作用，在真空中进行。
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2楼2009-01-10 20:21:09
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dolphin100

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):感谢你的参与！
libaosun(金币+1,VIP+0):多谢你的帮助，祝新年快乐！
可以的, 我看到过有人做纳米管中生物分子结构与性质方面的
Nanotube confinement Denatures Protein  Helices        JACS 2006 128, 6316
希望对你有点帮助吧
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
3楼2009-01-12 02:12:15
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libaosun

木虫 (正式写手)

自己顶一下

4楼2009-01-13 10:35:28
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libaosun

木虫 (正式写手)
自己顶一下
期盼大牛指教！
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5楼2009-02-06 16:15:31
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

水溶液中分散的多壁碳纳米管与血液蛋白质分子的作用研究

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 2-6 20:48
libaosun(金币+1,VIP+0):多谢你的帮助，祝新年快乐！ 2-8 13:47
孟洁 杨曼 王超英 孔桦 王睿 王琛 解思深 许海燕
中国医学科学院中国协和医科大学

新型炭材料 2007,22(3):218-226

文摘：

碳纳米管在水溶液中的稳定分散和与蛋白质分子的作用是实现其生物医学应用的重要研究内容之一。采用混合强酸结合超声处理的方法对多壁碳纳米管（MWCNTs）进行表面氧化处理,得到可以在无表面活性剂条件下稳定分散的MWCNTs水溶液。对该水溶液进行高速和超高速离心,通过扫描电镜、紫外/ 可见/近红外分光光度仪、激光动态光散射和X-射线光电子能谱分析等方法分别对留在水中和沉淀出来的MWCNTs进行表征。

结果表明,经过氧化处理的 MWCNTs表面引入了包括羧基在内的含氧基团,长度由初始的50μm变为500nm～800nm,且经过不同离心力作用下得到的上清液中MWCNTs的尺寸分布没有明显差别;MWCNTs水溶液在253nm处有与MWCNTs浓度相关的特征吸收峰,由此建立了测定水溶液中MWCNTs浓度的光谱分析方法。

此外,通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺（SDS）凝胶电泳和荧光光谱分析方法研究了分散在水中的MWCNTs对单一白蛋白、单一纤维蛋白原、以及两种混合蛋白的吸附作用,探讨了聚乙二醇甲醚（PEG）修饰抑制纤维蛋白原在MWCNTs上吸附的可能性。结果表明,MWCNTs对两种单一蛋白均有吸附,对纤维蛋白原的吸附更加强烈。在双蛋白混合溶液中,MWCNTs对纤维蛋白原分子具有强烈的倾向性吸附作用。经PEG分子修饰后,MWCNTs对纤维蛋白原的吸附程度有所降低。
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6楼2009-02-06 16:35:58
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

单壁碳纳米管无纺膜表面的PEG修饰及蛋白质吸附研究

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 2-6 20:48
libaosun(金币+1,VIP+0):多谢你的帮助，祝新年快乐！ 2-8 13:48
郭小天 孟洁 孔桦 宋礼 王超英 何朝辉 许海燕 解思深
中国医学科学院基础医学研究所
中国协和医科大学基础医学院
中国科学院物理所

中国生物医学工程学报 2005 24(6):763-767

摘要:
碳纳米管是一种纳米尺度的新型碳材料，具有独特的物理、化学性质。近年来，碳纳米管在生物医学领域的潜在应用前景已经引起科学界和产业界的极大兴趣与关注。与蛋白质分子的非特异性结合是碳纳米管应用于生物系统中必须考虑的基本问题之一。

本研究应用扫描电镜和酶联免疫法作为评价方法，定性和定量地分析了血浆中重要凝血因子纤维蛋白原在单壁碳纳米管薄膜表面的非特异性吸附行为；同时，采用聚乙二醇（PEG）分子对单壁碳纳米管薄膜（SWNT膜）进行了表面修饰，通过x．光电子能谱（XPS）对材料表面的化学组成进行了表征，并初步探讨了PEG修饰对纤维蛋白原分子在SWNT膜表面非特异性吸附的阻止作用。

实验结果表明，纤维蛋白原分子在SWNT膜表面有强烈的非特异性结合，吸附于薄膜表面的纤维蛋白原分子仍然保有自身的免疫原性。 SWNT膜表面可以被PEG分子修饰，连接在薄膜表面的PEG分子可以在一定程度上抑制一定浓度范围内的纤维蛋白原分子的非特异性结合。
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7楼2009-02-06 17:35:44
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libaosun

木虫 (正式写手)
多谢！自己顶一下！
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8楼2009-02-08 13:45:36
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