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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物化学 » Tyrosyl-tRNA synthetase 晶体结构在PDB上的编号？
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药化刘

铜虫 (正式写手)

[求助] Tyrosyl-tRNA synthetase 晶体结构在PDB上的编号？ 已有2人参与

我是做合成药物化学的，我想对我合成的化合物进行分子模拟对接，我选用的靶点蛋白是Tyrosyl-tRNA synthetase ，我在PDB上只找到了金黄色葡萄球菌和大肠杆菌的，因为我做抗菌用的是大肠、金黄、枯草和铜绿四种菌，所以我老师让我再找找有没另两种菌的Tyrosyl-tRNA synthetase晶体结构，在PDB我没找到，所以特地来求助各位虫友！
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1楼 2017-05-19 10:08:55
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
药化刘: 金币+10, ★有帮助, 感谢你的回答，这给我提供了一个思考的方向。送你10个金币。 2017-05-19 17:13:29
如果没有，可以同源建模
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2楼2017-05-19 12:15:21
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龙飞哥
祝福

发自小木虫Android客户端
3楼2017-05-19 12:22:38
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lglsr603
顶

发自小木虫Android客户端
4楼2017-05-19 12:24:54
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药化刘

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2017-05-19 12:15:21
如果没有，可以同源建模

不太懂同源建模的意思？

发自小木虫Android客户端
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5楼2017-05-19 14:16:41
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samule1978

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
药化刘: 金币+10, ★有帮助, 感谢你的回复。 2017-05-19 17:14:22
pdb没有的话就没有了，这些不同的菌的氨基酸序列有多大差别？
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6楼2017-05-19 14:29:36
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by samule1978 at 2017-05-19 14:29:36
pdb没有的话就没有了，这些不同的菌的氨基酸序列有多大差别？

不同菌种的这个蛋白氨基酸序列是有差异的吧，如果你需要的菌种里面的蛋白晶体结构没有解析，只能用其序列进行同源建模了
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7楼2017-05-19 15:28:51
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药化刘

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by samule1978 at 2017-05-19 14:29:36
pdb没有的话就没有了，这些不同的菌的氨基酸序列有多大差别？

我也不清楚，可能感觉做了四种菌，模拟的时候是不是应该把四种菌中的这个蛋白都模拟上。所以让我找找。
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8楼2017-05-19 17:11:37
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