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铜虫 (小有名气)

[求助] 如何用pymol分析并得到蛋白突变后的结构 已有2人参与

各位大侠好,我是做蛋白定点突变的,已经突变了几个位点,想进一步分析一下这些突变是否造成蛋白结构的改变,突变前和突变后结构有何变化。但是我们实验室没有人做过结构这方面的东西,看了文献,有人用pymol分析,想请教一下各位大神具体怎么用这个软件?请各位大神赐教,谢谢啦,另外,可不可以上次一份这个软件的安装包?捉急中.....
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hclwonder

新虫 (正式写手)

通常突变几个氨基酸不至于造成蛋白质结构的改变。但突变位点及其周围会有一定改变及性质变化。从而可能影响其活性。
pymol是不错的分子显示软件,(搭配插件)也能做一些简单的分析。但不足以满足你想要做的事(可以做突变,但难以做突变后的结构优化等)。
pymol小木虫有人上传过,搜索一下应该可以找到的。

发自小木虫Android客户端
2楼2017-05-19 09:29:55
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


【答案】应助回帖

下载一下直接安装就可以,先安装python语言,然后安装pymol,免费软件,很好的可视化界面,操作简单
3楼2017-06-16 11:14:45
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莫落

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有个公众号刚推送的里面就有视频介绍怎么使用pymol进行AA的替换,是一个老外讲的系列课,讲的挺不错的。

哦哦,公众号是:知了窝生物。

求小红花~
4楼2018-07-12 17:20:15
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