| 查看: 3536 | 回复: 3 | ||
小样儿bb新虫 (初入文坛)
|
[求助]
如何在NCBI上确定菌属？ 已有1人参与
|
|
筛选得到一株菌，16srDNA测序后在NCBI序列对比，得到很多相似性99%的菌属，但是构建进化树时，同源性特别低，应该怎么办呢？ 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
有没有人能给点建议
已经有5人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
-
全日制（定向）博士
已经有5人回复
-
萌生出自己或许不适合搞科研的想法，现在跑or等等看？
已经有4人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
-
参与限项
已经有3人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复
小蓝僧
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1185.6
- 散金: 116
- 红花: 3
- 帖子: 272
- 在线: 124.8小时
- 虫号: 1186408
- 注册: 2011-01-09
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
首先用软件打开你的测序结果，比如chromas lite或者bioedit，去除2端测序质量低的序列，然后用ezbiocloud网站进行比对，这里面都是比较准确的模式种，不像NCBI里面的序列太多太杂。照我说的做，应该对你有帮助? 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2017-05-16 17:46:48
liuhaolin3
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 16918.5
- 红花: 15
- 帖子: 1163
- 在线: 178.7小时
- 虫号: 1116160
- 注册: 2010-10-08
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2017-05-17 02:24:20
憬翚
金虫 (初入文坛)
草履虫
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1329.5
- 红花: 1
- 帖子: 44
- 在线: 9.9小时
- 虫号: 3369305
- 注册: 2014-08-16
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
4楼2017-05-18 08:24:31